omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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果实发育时期的转录组热图中，有几个基因在各个时期均表现低FPKM... 已采纳

感觉有误可以重新做实验，加大生物学重复，取样要仔细；或者做qpcr验证一下；

回答于 2020-06-22 17:37

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你的基因组注释文件GFF是不是弄错了，既有拟南芥的基因，又有水稻的基因；

回答于 2020-06-22 17:35

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一般做差异分析的软件会帮你考虑这些问题，比如DESseq2做差异分析就会过滤掉地表达的基因。

回答于 2020-06-22 17:34

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hmmer一般搜索蛋白的结构域，你只要有蛋白序列就可以搜索使用；

回答于 2020-06-22 16:56

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circos是用了绘制圈图的，你这个不是圈图绘制不了；建议你用mapchart软件绘制柱子，再用AI编辑一下就好了：https://www.omicsclass.com/article/397

回答于 2020-06-19 10:24

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上下左右拖动一下拉开一下；或者导出pdf用AI修改编辑一下；

回答于 2020-06-18 09:53

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建议学习docker ，不需要为安装软件烦恼： docker安装有视频课程：docker：https://ke.qq.com/course/2202806?saleToken=2099432&from=pclink

回答于 2020-06-18 09:51

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写scaffold；是什么就写什么，不能改，不然不对应会报错

回答于 2020-06-18 09:49

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你的bed文件有问题，你先点一下旁边的example，对比看一下格式是否有问题；

回答于 2020-06-17 09:59

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不太明白你的意思。你的家族基因特点是有好几个保守结构域吗，如果有残缺就不算这个家族的成员吗？这个你可以再看看文献，看看别人在其他的物种里面怎么研究你这个家族的，参考一下；

回答于 2020-06-17 09:57