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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4092 个回答

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老师您好。我删除后重新导入虚拟电脑,但是遇到了挂载不成功的问...

你的命令有错误,最后差了一个挂载目录名字,再看看这里:https://www.omicsclass.com/article/260

回答于 2020-07-29 10:35

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为什么我的bioLinux打不开.fa的文件呢

利用ll 命令查看一下你输入的这个文件是否在当前目录下,或者对比文件名字是否写错;

回答于 2020-07-29 10:08

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在做MCScan出现了一下问题,求解

你可以先检查一下所有输入文件的路径是否写错; 然后再看看文件里面的基因ID是否互相能够搜索到,例如:

回答于 2020-07-29 10:07

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请问各位老师,E-value(e值)设定的根据是什么?对结构域筛选影...

你说的是hmmer搜索之后的结果文件里面的E值吗,这个不同的家族筛选条件不一样,可以看看其他文献设置借鉴一下; 筛选的条件不一样,结果是不一样的;

回答于 2020-07-28 16:53

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老师,您好,我下载下geo原始数据,经标准化处理后,基因的表达...

你下载错了把,怎么数字这么大,我们这里有课程建议你看一下,避免很多弯路浪费时间:GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化 

回答于 2020-07-28 12:38

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老师,从GEO数据库下载的数据是标准化后的RNA-seq数据,能用哪个...

如果下载的是芯片转录表达数据用limma,  如果是高通量测序的转录组数据用DEseq2

回答于 2020-07-27 11:10

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老师,我照着视频里的指令输入的,但报错了,请问有什么解决方法...

你看看的是哪个视频,这个脚本已经不用了; 你再看看视频课程吧: 学习链接:基因家族分析实操课程、

回答于 2020-07-27 10:54

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R怎样读取下载好了的TCGA数据

那你重新下载,可能是数据下载不完整, 下载数据参考:https://www.omicsclass.com/article/1060

回答于 2020-07-27 10:52

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为什么smart输出结果只是文本没有图呢

再看看,是不是哪里点错了:https://www.omicsclass.com/article/681

回答于 2020-07-27 10:50

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第一张图是geo直接下载的矩阵文件,是经校准的log数值,而在按照...

你这个行名是芯片的探针ID,需要通过芯片的GPL信息转换成对应的基因ID,课程里面有讲的:GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化 

回答于 2020-07-27 10:48