擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
生物信息
理论上应该尝试各种模型,根据检验结果选择最合适的模型进行计算。但在实际操作中,可先尝试选用较简单的距离模型,比如 p-distance。第三个参数是 Gap/Missing Data Treatment。大多数建树方法会要求删除多序列比对中含有空位的列。但是根据遗传距离度量方法的不同,删除原则也不同。如果是以序列间不同残基的个数来度量遗...
回答于 2020-09-28 17:14
目前我没有发现,你自己可以搜索文献查找一下
回答于 2020-09-28 13:00
你再哪里得到的ID,去查一下就好了;
回答于 2020-09-28 12:59
转录组课程里面有对应的脚本你可以去看看: https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM
序列的ID在motif和进化树中是否一致,检查一下
回答于 2020-09-28 12:58
seqid文件也检查一下,看看是不是有问题
回答于 2020-09-28 12:57
不同的家族特点不一样,你这个家族可能就是这个特点;
回答于 2020-09-28 12:55
可以的,放心使用
回答于 2020-09-28 12:54
可能是转换的GTF文件有问题
报什么错了? 计算出来没问题就行
回答于 2020-09-28 12:52