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各位老师 计算KaKs时 加上空缺的- 总长度是2215 不是3的倍数 那...

cds比对可以先蛋白比对,再转换成cds比对,就不会出现这种情况了:参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1939

回答于 2020-09-28 18:05

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mega构建进化树如何选择模型

理论上应该尝试各种模型,根据检验结果选择最合适的模型进行计算。但在实际操作中,可先尝试选用较简单的距离模型,比如 p-distance。第三个参数是 Gap/Missing Data Treatment。大多数建树方法会要求删除多序列比对中含有空位的列。但是根据遗传距离度量方法的不同,删除原则也不同。如果是以序列间不同残基的个数来度量遗...

回答于 2020-09-28 17:14

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请问有没有有关一个“科”物种转录组的汇总研究

目前我没有发现,你自己可以搜索文献查找一下

回答于 2020-09-28 13:00

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编号以TC开头的基因能在什么数据库里查到序列

你再哪里得到的ID,去查一下就好了; 

回答于 2020-09-28 12:59

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GO富集分析

转录组课程里面有对应的脚本你可以去看看: https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM  

回答于 2020-09-28 12:59

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请问转录本绘图时,我输入了motif起始序列,但为什么结果图中未...

序列的ID在motif和进化树中是否一致,检查一下

回答于 2020-09-28 12:58

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比较基因组学作图

seqid文件也检查一下,看看是不是有问题

回答于 2020-09-28 12:57

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所有基因都只含一个相同的结构域,没有其他结构域了,这正常吗?

不同的家族特点不一样,你这个家族可能就是这个特点; 

回答于 2020-09-28 12:55

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有些GEO数据没发表论文/文章,可以拿来用吗?

可以的,放心使用

回答于 2020-09-28 12:54

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建立基因组索引时gene_length文件出问题

可能是转换的GTF文件有问题

回答于 2020-09-28 12:54