omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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非模式物种kegg富集分析时，报错

转录组分析镜像更新到v1.1 试试： docker pull omicsclass/rnaseq:v1.1

回答于 2021-07-26 09:30

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你说的是课程吗？：https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1211590812&share=2&shareId=1030291076 看课程的第一节

回答于 2021-07-26 09:24

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基因的cds序列可以根据基因组的GFF注释信息或者位置信息，到基因组中截取；我们可以提供提取服务，找群主：787097236

回答于 2021-07-26 09:22

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NCBI上面的基因组整理的GFF不标准，可以到别的网站下载基因组文件；或者自己写脚本提取；或者找群主付费修改GFF文件787097236

回答于 2021-07-26 09:20

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是的， DESeq2要求输入的是readcount 值为整数，你这数据不是整数不能输入；

回答于 2021-07-20 10:25

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没用过tbtools做共线性，不清楚哪里出错了；我们使用mcscan做共线性，详细见课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-07-20 10:24

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我们现在不支出biolinux了，用更好的工具docker ：https://www.omicsclass.com/article/1198

回答于 2021-07-19 10:28

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不用过滤这些都是myb基因

回答于 2021-07-19 09:32

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样本太少了，如果是转录组测序的数据可以试试 ebseq这个R包

回答于 2021-07-18 09:11

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系统版本没有设置正确：还有存储和内存不是一个东西： docker 默认是安装到C盘的，可能你的C盘空间不足吧；做生信分析还是弄个好些的电脑，避免不必要的麻烦错误看看这个安装：https://www.omicsclass.com/article/1243

回答于 2021-07-16 09:20