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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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win10系统,virtualbox6.1.26,导入虚拟电脑ova文件,进度条到了...

组学大讲堂慢慢不支持vbox的bio-linux,用更好的工具docker,安装及使用课程见: https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0 或者扫码二维码观看:

回答于 2021-08-10 13:10

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老师,我在提取gene_exon_info.gff文件提取时运行正常,但是提取...

你可以查一下 那些没有提取出来的基因,在输入GFF里面是否存在; 可能ID不一致导致提取失败;

回答于 2021-08-10 10:56

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ANNOVAR注释完了没有列名

annovar注释完了之后,vcf里面的信息变成了otherInfo otherinfo之后列的信息可以到输入的vcf文件中查询;

回答于 2021-08-10 10:54

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老师,我从文献查找到了基因ID,类型是这样的:LOC_Os01gll200.1...

你用的 参考基因组 和LOC开头的 参考基因组不一样,两套 ID; 用一致的参考基因组,ID就一致了;

回答于 2021-08-09 09:24

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在绘制共线性图是出现“zerodivisionerror: float division by ze...

可能 配置文件有问题吧,你再检查检查配置文件是否有问题;  看看这个: https://www.omicsclass.com/question/1361  还有就是 layout文件和seqid文件结尾不要有空行;

回答于 2021-08-08 10:04

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linux 用conda安装软件一直报错的问题

biolinux  太老了,我们已经不支持了; 用更好的工具docker: https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0

回答于 2021-08-06 10:42

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在BSA分析结果给的候选区域文件quantile99_SNPs_in_region_gene_...

如果是我们公司做的项目,有问题可以找对应的销售,他们会给您详细的解答。

回答于 2021-08-05 10:33

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老师,您好!我同时测了二代和三代转录组,都是无参,数据看不懂...

二代的无参转录组结果解读可以看看: https://bdtcd.xetslk.com/s/1TmM7v

回答于 2021-08-04 13:26

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按照课程里的代码用R分析TCGA数据差异基因的KEGG富集,发生报错

网速不好吧,等会重新运行这行代码再试试;

回答于 2021-08-04 13:25

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老师 你好,我通过Git bash利用代码 tcga_gene_exp_download下载...

重新运行这个脚本试试;  不行的话用后面课程的 docker吧;

回答于 2021-08-03 09:25