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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4146 个回答

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微生物多样性分析课程:运行r脚本出错 ,提示there is no packag...

请用指定版本的镜像:omicsclass/ampliseq-q1:v1.2

回答于 2021-09-22 09:07

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共线性分析做组间时,anchors文件只有以下内容,进行后续筛选和...

删除文件末尾的空行:https://www.omicsclass.com/question/4151

回答于 2021-09-18 13:03

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python 版本的mcscan 绘图输出报错, need more than 0 values t...

*simple文件结尾不要有多余的空行,不然python 版本的mcscan会报错; 其他文件末尾的空行也检查一下,有多余的空行删除 删除空行应该就可以解决

回答于 2021-09-18 12:59

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kaks计算

cds比对可以先蛋白比对,再转换成cds比对,就不会出现这种情况了:参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1939

回答于 2021-09-17 16:27

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基因组测序品种选择问题

找个 比较重要的 品种测序吧 或者做泛基因组,多组几个品种

回答于 2021-09-17 11:50

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GATK HaplotypeCaller - Shutting down engine

参考答案: https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/community/posts/360075181171-HaplotypeCaller-Shutting-down-engine-Encountering-a-large-genome

回答于 2021-09-17 09:37

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gatk报错:java.lang.IllegalStateException: Read position too...

增加参数:--create-output-bam-index false 换最新版本:/share/work/biosoft/GATK/gatk-4.2.2.0/gatk

回答于 2021-09-17 09:30

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安装好Docker以后,搜索出的镜像没有TAG ID,按照给的命令下载镜...

docker的镜像的不同tag这里是看不到的,需要到dockerhub的官方网站查看: 需要下载对应版本的镜像,直接复制相应的命令: 如果还下载失败额可以试试:docker pull docker.io/omicsclass/gene-family:v1.0.1

回答于 2021-09-16 17:36

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您好老师,Ka/Ks计算,扩展运行内存后,任务仍然被杀死,这两个...

输入文件贴一下,命令行也不完整, 我只能猜你的输入文件有问题;

回答于 2021-09-15 09:43

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转录组上游分析之定量比对Hisat2出现内部异常错误

fastp也有同样的问题说明 输入的fastq数据有问题,不完整或者格式不对你再检查一下;

回答于 2021-09-15 09:42