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泛基因家族分析cds提取出现killed
数据量大，需要电脑内存足够才行，不然系统会自动杀死：https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2024-12-23 10:19
KEGG富集分析
这个没法调整，你可以试试输入通路试试，比如 GO，REACTOME等；如果还是没有说明你的差异分组没有通路富集； 或者换一种富集方法，GSEA富集方法；
回答于 2024-12-22 15:53
vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel sn...
看看你的过滤条件是不是太严格了，你适当放宽条件； 不同的数据测序深度，样本数量都不一样，灵活调整参数； 不知道你的过滤条件是啥，最好把你的数据基本情况介绍一下，使用的命令行贴一下好给你建议；
回答于 2024-12-22 09:34
单细胞高级分析代码的报错求助
建议截图解释问题，不知道你是运行R命令，还是shell命令； 你这个文件在当前文件夹吗？检查一下： celltype.tsv 如果在，打开看一下内容是否正确
回答于 2024-12-20 18:33
有关于GSEA富集分析参数设置
GSEA 富集分析是先对两组之间所有基因的表达差异程度（通常是差异比较的fold change）进行排序，之后再看通路里面的基因在排序上是否有富集，具体看看这里：https://www.omicsclass.com/article/230所以这里的 minGSSize和maxGSSize 是关心的信号通路等里面基因的数量限制，基因数量太少的和太多的信号通路等不纳入GSEA富集...
回答于 2024-12-20 09:22
怎么从全部的300份重测序数据的vcf.gz文件中抽出自己的想要的200...
可以用vcftools提取想要的样本SNP数据，准备一个文本文件，一个样本名字一行：sample.txt vcftools --vcf input_file.vcf --keep sample.txt --recode --recode-INFO-all --out sub_SNP
回答于 2024-12-19 17:21