OTU互作网络分析用MENA
MENA，一个可以利用OTU数据进行在线分子生态网络分析的网站，帮你搞定OTU互作网络图。
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- Daitoue
- 发布于 2018-04-22 21:19
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Daitoue
获取MOTIF 位置信息矢量图
MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解，是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具，结果输出一般是有四个文件，motif的图形展示文件（LOGO），txt文本，html的网页信息文件及xml...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 21:05
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landy
两分钟看懂基因组注释GFF文件
随着大数据时代的到来，很多生物科研工作者都接触了基因组相关实验。在做数据分析的时候，会用到一个很重要的文件，就是基因组的注释文件，也就是今天分享内容的主角GFF文件！ 什么是GFF文件...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 21:00
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做进化树，到底哪种算法适合我？
进化树（英语：phylogenetic tree）又称演化树（evolutionary tree），是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树状图。是一种亲缘分支分类方法（cladogram）。在图中，每个节点代表其...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 20:56
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一键搞定批量序列提取TBtools！
用基因ID提取其序列很简单，ctrl+F找到ID对应的序列，ctrl+C、ctrl+V就好了，少量基因的还OK，但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽？ 这里墙裂推荐一个软件，功能很强大，就是TBtoo...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 19:08
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分分钟教你绘制基因结构图！GSDS
今天介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server，简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构，清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 18:59
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两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！
使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行，所以使用前记得要安装JAVA。 第一步：选择合适的树形 使用File – open 打开树文件（一般为.nwk文件），在左上方绿色...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 18:38
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病毒衍生的small RNAs： 宿主与病毒互作的分子“证据”
病毒是专性寄生，需要借助宿主才能进行复制，繁殖。在病毒的复制循环过程中，其RNA中间体可以被宿主的不同抗病毒途径RNA decay、RNA interference、 and RNase L pathways识别并降解，从而...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 18:12
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omicsgene
ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看
参考基因组下载，Ensembl，NCBI，JGI等网站下载使用，可视化浏览,基因查看与下载等；
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:59
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从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据
用迅雷替代官方的prefetch批量下载SRA测序数据，更快更稳定！
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:37
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sci-hub文献下载网站
学术界的“盗版女王”，哈萨克斯坦研究生兼女黑客亚历山德拉·埃尔巴克彦。文末附可用链接，再也不用担心下载不到文章了。
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:26
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phytozome植物基因组下载网站
今天主要介绍一下Phytozome网站基因组如何下载，通过blast查询多个物种中得同源基因，以及根据基因相关功能结构域等批量下载相关基因的CDS，PEP等序列信息；
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:21
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红橙子
