绘制Upset 图

Upset 图(Upset Plot)是一种用于可视化集合间交集的图表,是传统维恩图的替代方法,特别适用于集合个数多或交集关系复杂的场景。它通过柱状图、点图和辅助条形图来直观展示集合交集的大小及分布。

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-28 11:01
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核苷酸多样性π的计算

核苷酸多样性(nucleotide diversity),记为π,是分子遗传学中一个重要的概念,可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平,也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...

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  • 发布于 2024-11-12 18:14
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TWAS分析的原理和工具

TWAS(Transcriptome-wide Association Study)是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法,通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析,以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。

单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌(HNSCC)(GSE181919)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肝细胞癌(HCC)代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里,我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组:原发肿瘤、门...

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  • 发布于 2024-10-31 14:05
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DockerHub镜像无法下载的解决方案

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  • 发布于 2024-08-30 16:31
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给进化树标定化石时间

进化树(Phylogenetic Tree)是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每个分支点(节点)代表一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-10 17:43
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Mac | Mac M 芯片应用意外退出问题

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  • 发布于 2024-07-04 09:50
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蛋白质组学数据定量搜库 | MaxQuant软件的使用

简介: MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一,免费使用,目前认可度相对较高,可针对多种质谱数据格式(.raw、.wiff、.mzML、.mzxml)。且内置了自己的肽段搜索引擎-...

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  • rzx
  • 发布于 2024-06-26 11:52
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GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

单细胞数据挖掘示例代码

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  • 发布于 2024-06-11 17:18
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illumina平台转录组299/样品,组学大讲堂学员专属福利!速来报名吧!

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MAFFT介绍

MAFFT简介 MAFFT是一种流行的多序列比对软件,广泛应用于生物信息学领域,特别是在系统发育分析和功能基因组学研究中。它通过采用快速傅里叶变换(FFT)来提高比对的速度和准确性,适用于大规...

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  • 发布于 2024-03-04 13:43
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微生物与环境因子,代谢物,功能等相关性分析linkET

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  • 发布于 2023-12-19 08:20
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叶绿体或线粒体重复序列圈图绘制

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  • 发布于 2023-12-18 17:12
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细胞焦亡、铁死亡及铜死亡等基因集

细胞焦亡、铁死亡及铜死亡浅析

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  • 发布于 2023-12-14 14:37
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一行代码检查GWAS分析中表型数据的错误

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  • 发布于 2023-12-13 10:56
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trimAL | 多序列比对中剪切掉不保守部分的参数

在生信分析时,经常会做一下蛋白多序列比对。对于比对结果中,一些不保守的列,我们可以选择剪切掉。再进行之后的分析,比如构建进化树,进化树的构建会容易很多。 剪切序列时有一个非常好用的...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-13 10:51
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叶绿体或线粒体基因组重复序列分类及鉴定

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  • 发布于 2023-11-29 11:45
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screen软件快捷键修改

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  • 发布于 2023-11-06 16:06
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PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

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  • 发布于 2023-10-24 11:42
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