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awk基本参数解释

awk擅长于对文件按行操作，每次读取一行，然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-25 10:29
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R语言计算平均值，中位数

Mean（）求平均值 通过求出数据集的和再除以求和数的总量得到平均值 函数mean()用于在R语言中计算平均值。语法 用于计算R中的平均值的基本语法是 - mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 15:53
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linux下替换文件中的换行符

之前在linux系统执行以下命令： ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果，百度之后发现 sed是按行处理文本数据的，每次处理一行数据后，都会在行尾自动添加trailing newline...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 10:35
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linux:简单使用（2）

linux

推荐一个好用文献管理软件：CNKI E-Study——数字化学习与研究平台(1)

CNKI E-Study——数字化学习与研究平台的学习使用

R语言、文件读取（2）

R、R语言、文件读取、xlsx

Python虚拟环境解决不兼容问题

采用Python 虚拟环境，解决python不同版本，不同包 间不相容的问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-18 10:11
  • 阅读 ( 3270 )

pip安装python模块

python模块安装还是非常简单的，只要把pip安装好之后，一切都用一条命令搞定。 如果你使用的是从 python.org 下载的Python 2 >=2.7.9 或者Python 3 >=3.4，那么pip是已经安装了。 1....

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:47
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如何将SNP标记转化成可跑胶验证的CAPS标记

现如今，基于高通量测序得到的SNP信息无疑是海量的，然而SNP标记的验证却并不容易实现。其最好的验证方式是一代sanger测序，不过价格较高，而且通量低。如果SNP刚好位于酶切位点上，就可以将其转化为CAPS标记，利用跑胶的方式对其进行验证，既便宜又好用。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 08:46
  • 阅读 ( 11715 )

微生物组间差异分析之LEfSe

lefse分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-17 21:52
  • 阅读 ( 36221 )

blast序列比对中E值是什么意思？

E value——E（Expect）值，表示随机匹配的可能性。E值越大，随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时，具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-17 10:45
  • 阅读 ( 19089 )

转录组的3种分析模式

转录组分析的3种模式及分析流程

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-13 22:01
  • 阅读 ( 6764 )

MEGAN 分类学树状图 饼图说明

MEGAN分类柱状图解释

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-11 16:06
  • 阅读 ( 4878 )

如何将基因组的注释文件gff转化成基因的注释文件gtf

在做分析的时候，有时候我们需要将gff文件转化为gtf，如何转化呢？ 这里有一个小工具，虚拟机的bio-linux自带不需要安装，就是gffread： 命令行格式：gffread   gff文件   -T  -o  gtf文件，...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-11 10:55
  • 阅读 ( 7464 )

Perl去除一个数组中的重复元素

Perl去除一个数组中的重复元素

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-09 16:32
  • 阅读 ( 3356 )

怎么用Perl脚本得到反向互补序列

怎么用Perl脚本得到反向互补序列

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-09 15:51
  • 阅读 ( 4885 )

biolinux 虚拟机内存不能为written怎么解决

biolinux虚拟机导入之后打开报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-27 21:27
  • 阅读 ( 6415 )

获取MOTIF 位置信息矢量图

MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解，是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具，结果输出一般是有四个文件，motif的图形展示文件（LOGO），txt文本，html的网页信息文件及xml...

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  • landy
  • 发布于 2018-04-22 21:05
  • 阅读 ( 18626 )

施一公：如何提高英文的科研写作能力

这里有大牛施一公亲自指导如何写英文文章。

当下，转录组文章怎么写？

以一篇今年发表在《BMC Genomics》上的转录组文章为切入点，探讨18年转录组文章需要怎么写？

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-04-21 22:44
  • 阅读 ( 7647 )