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两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！

使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行，所以使用前记得要安装JAVA。  第一步：选择合适的树形 使用File – open 打开树文件（一般为.nwk文件），在左上方绿色...

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  • landy
  • 发布于 2018-04-22 18:38
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PubMed文献按影响因子排序

PubMed 按影响因子过滤文献

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:45
  • 阅读 ( 24998 )

外源插入位置查找好方法

简单高效的查找外源基因插入位置的方法，并可以设计共显性标记，方便后续实验验证。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:32
  • 阅读 ( 6840 )

cactus下载

不同物种构建泛基因组的时候需要用到Progressive Cactus 参考文章：Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomic 下载： 软件github：https://github.com/Comp...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-08-07 11:15
  • 阅读 ( 781 )

cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。

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  • rzx
  • 发布于 2024-04-30 17:41
  • 阅读 ( 8773 )

在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍： Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。 下载链接：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式： 1. 点...

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  • rzx
  • 发布于 2024-03-19 17:01
  • 阅读 ( 4272 )

使用NCBI——Batch Entrez批量下载蛋白序列

使用NCBI自带的工具实现蛋白序列的批量下载

linux使用ossutil下载阿里云数据

linux使用ossutil下载阿里云数据

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-31 16:30
  • 阅读 ( 5605 )

从fasta基因组中提取反向互补序列

从fasta基因组中提取反向互补序列，借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件     -bed 基因位置 共6列：【染色...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-27 14:22
  • 阅读 ( 3130 )

GenotypeGVCFs 运行速度慢解决方法

GenotypeGVCFs 运行速度慢解决方法

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  • 安生水
  • 发布于 2023-02-07 11:44
  • 阅读 ( 4051 )

MISA(在线)注释叶绿体基因组SSR

SSR (Simple Sequence Repeat)，即简单重复序列，是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术，也称为微卫星序列或者串联重复。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-02-06 11:04
  • 阅读 ( 4668 )

将fasta序列多行变单行——使用 awk 或 seqkit 或 python

fasta序列多行变单行

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-26 16:03
  • 阅读 ( 7494 )

GEMMA软件下载安装

GEMMA软件下载安装

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  • 安生水
  • 发布于 2021-11-12 15:07
  • 阅读 ( 5286 )

启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库！

基因结构有很多概念，经常会把我们绕晕，之前小编给大家整理过mRNA、CDS、ORF等概念知识（感兴趣的点击查看：CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清）；今天我们再补充一些概念性知识及着重说下启动子以...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-09-07 09:16
  • 阅读 ( 18300 )

NCBI高通量测序数据SRA数据库下载新方法

SRA数据下载方法

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  • 安生水
  • 发布于 2019-07-12 11:39
  • 阅读 ( 6258 )

Graphpad Prism绘制分组直方图

Graphpad Prism绘制分组直方图

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  • 安生水
  • 发布于 2019-01-18 15:07
  • 阅读 ( 15816 )

批量修改进化树中的名称及添加分组名称

批量修改进化树中的名称及添加分组名称

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  • 安生水
  • 发布于 2018-12-29 15:18
  • 阅读 ( 21306 )

bedtools批量提取基因组指定位置序列

bedtools批量提取基因组指定位置序列

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  • 安生水
  • 发布于 2018-11-09 13:02
  • 阅读 ( 17359 )

多基因组基因水平共线性分析

多基因组基因水平共线性分析

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-19 13:39
  • 阅读 ( 6982 )

详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息

详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-09-21 13:19
  • 阅读 ( 33324 )