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Orthofinder-构建物种系统发育树(Phylogenetic tree)

在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍，这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树（Phylogenetic tree）。 在Orthofinder结果文件中有一...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-15 17:33
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Minimap2安装与使用

minimap2是生信大牛Heng Li在2018年发表的三代序列比对工具。与传统的bwa相比，Minimap2可以用于三代测序， 也支持 splicing awared 比对；与一些传统三代比对工具相比，Minimap2 速度非常快，...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-05-12 11:07
  • 阅读 ( 12845 )

linux使用ossutil下载阿里云数据

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-31 16:30
  • 阅读 ( 4514 )

从fasta基因组中提取反向互补序列

从fasta基因组中提取反向互补序列，借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件     -bed 基因位置 共6列：【染色...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-27 14:22
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叶绿体基因组四个区边界作图——irscope：本地化及使用教程（2023.02）

大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构，即由LSC、SSC以及一对IR区域构成，IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比...

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  • 发布于 2023-02-15 15:53
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GenotypeGVCFs 运行速度慢解决方法

GenotypeGVCFs 运行速度慢解决方法

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  • 安生水
  • 发布于 2023-02-07 11:44
  • 阅读 ( 3391 )

将fasta序列多行变单行——使用 awk 或 seqkit 或 python

fasta序列多行变单行

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  • 发布于 2022-12-26 16:03
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win11/win10安装最新版本的docker

win11安装docker

GEMMA软件下载安装

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  • 安生水
  • 发布于 2021-11-12 15:07
  • 阅读 ( 4927 )

启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库！

基因结构有很多概念，经常会把我们绕晕，之前小编给大家整理过mRNA、CDS、ORF等概念知识（感兴趣的点击查看：CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清）；今天我们再补充一些概念性知识及着重说下启动子以...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-09-07 09:16
  • 阅读 ( 16804 )

NCBI高通量测序数据SRA数据库下载新方法

SRA数据下载方法

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  • 安生水
  • 发布于 2019-07-12 11:39
  • 阅读 ( 5668 )

Graphpad Prism绘制分组直方图

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  • 安生水
  • 发布于 2019-01-18 15:07
  • 阅读 ( 15062 )

bedtools批量提取基因组指定位置序列

bedtools批量提取基因组指定位置序列

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  • 安生水
  • 发布于 2018-11-09 13:02
  • 阅读 ( 16720 )

多基因组基因水平共线性分析

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-19 13:39
  • 阅读 ( 6638 )

graphpad prism绘图时，Y轴的缺口设置

绘制柱状图，Y周断裂方法设置

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-09-17 17:05
  • 阅读 ( 39877 )

在BIOS中开启VT，BIOS开启VT虚拟化技术图文教程

Virtualization Technology（VT），中文译为虚拟化技术，英特尔（Intel）和AMD的大部分CPU均支持此技术，名称分别为VT-x、AMD-V。VT开启之后对虚拟机，安卓模拟器的性能有非常大的提高。下面就跟小编一起来看看怎么在BIOS中开启VT

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-15 11:45
  • 阅读 ( 33957 )

cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-01 18:50
  • 阅读 ( 294988 )

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop，用好了这两个软件也会使你的文章配图增色不少，甚至事半功倍。

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  • 发布于 2018-07-19 11:47
  • 阅读 ( 9324 )

MCScanX 在biolinux上安装及使用

MCScan安装与共线性分析练习

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 13:58
  • 阅读 ( 26450 )

Excel数据分析技巧之双因素方差分析

>>方差分析之双因素方差分析 小编在节前做过一期使用excel表进行单因素方差分析的推送，反响不错，小编也颇受鼓舞！但是，在许多情况下，单因素方差分析已经不能满足实际分析的需要。比...