有参转录组测序分析,各个样品的数据与参考基因组的比对效率多高才能够满足后续分析?



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最佳答案 2018-09-04 12:54

与参考基因组的比对效率与多个因素有关,包括基因组组装质量、测序质量、有无污染等;一般来说,与参考基因组的比对效率在70%以上时,该基因组可以满足后续的分析需求。当比对效率低于60%时,需要考虑换参考基因组或者按照无参转录组分析策略进行分析。

但是,比较特殊的情况得特殊情况特殊处理。分析得灵活。

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