5 旧转录组数据是否还能重新分析一遍?

老师,你好!我们实验室有一批很早之前的转录组数据,那时公司提供的分析内容很少,而且用的基因组版本也比较久,我想重新分析一遍可以吗?

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1 个回答

omics007

你好,可以的。但是需要确认几个问题(仅针对illumina测序仪):

1. 当时公司是否给你提供了原始数据,还是仅仅提供了结题报告?一般原始数据比较大,单端测序的话,一个样品对应一个文件,双端测序的话,一个样品对应两个原始数据文件。

2. 你的数据是单端测序还是双端测序?读长是多少?

3. 原始数据里是否已经清掉了测序接头?如未去除,还得找当时的测序公司提供接头序列。

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