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4天前 回答问题

单端测序(Single-read):是指测序引物结合位点只连接到待测片段的一端,然后末端加上接头,将片段固定在flowcell上形成簇,上机测序单端读取序列。 双端测序(Paired-end):是指在构建待测文库时在两端都加上测序引物结合位点,在第一轮测序完成后,去除第一轮测序的模板链,用对读测序模块引导互补链在原位置再生和扩增,以达到第二轮测序所用的模板量,进行第二轮互补链的合成测序。 通常情况下转录组测序都采用的是Paired-end测序法,小RNA测序采用单端50bp测序。

4天前 回答问题

理论上技术是可行的,但是通常会根据测序对象长度的不同,在测序建库的时候会选择不同的片段大小,测序读长也会有不同。一般来讲,如果要进行microRNA测序的话,通常将microRNA分离出来,单独进行测序可。mRNA测序,通常建库时选择300bp大小片段,采用150PE测序。而长链非编码RNA(lncRNA)存在正向转录和反向转录,所以常采用链特异性建库测序。

2019-06-11 11:25 回答问题

你写的应该可以理解为一个东西,但是你看看是否表述不太准确,你是不是说转录因子与转录共调控因子?转录组共调控因子:又称转录中介因子(trancriptional intermediary factors,TIF)/共调节因子(co-regulators)、 DNA 共激活因子(co-activators),是指能与转录调节因子结合,可以提高它们的转录激活。

2019-06-04 22:14 回答问题

​gDNA(genomic DNA,基因组DNA):是指有机体在单倍体状态下的DNA全部含量。广义的基因组也指某一体系(如核或细胞器)中的DNA,它包括编码或细胞中固有的核糖体DNA(rDNA)、线粒体DNA(mtDNA)、tRNA基因及其它RNA编码。 cDNA是以mRNA为模板,在适当引物的存在下,由mRNA经过反转录而得到的DNA,是mRNA链互补的DNA链,其内部已无内含子等结构,值得说明的是,目前火热的二代测序均是先将RNA反转录组成cDNA再进行测序的。

2019-06-04 22:12 发起提问

2019-06-01 14:27 发表了文章

2019-06-01 14:20 发表了文章

2019-06-01 14:16 发表了文章

2019-06-01 14:09 发表了文章

2019-06-01 13:56 回答问题

1,fold change的意思是样本间表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距。2,Q-value,是P-value校正值,P值是统计差异的显著性的。Q值比P值更严格的一种统计。