...时含有3个基因 我想利用这三个基因先聚类 然后建进化树分析 怎么同时进行这三个基因的联合聚类呢 cd-hit应该是用于单独一个基因的聚类把（ps: cd-hit聚类后我们通常是采用代表序列分析把 那3个基因分开聚类后 可能得到的代...
我是想在mac上做两个基因组共线性图吗？想请教下您！我倒腾了很久不知道怎么做！
...觉少点音乐，所以又打开xmms 来点音乐；当然听点音乐还不行，MSN 还得打开，想知道几个弟兄现在正在做什么，这样一样，我在用beinan 用户登录时，执行了gedit 、xmms以及msn等，当然还有输入法fcitx ；这样说来就有点简单了，一...
...和数据下载工具 进行数据下载。 解决方案： 安装最新版本的TCGAbiolinks 即可： # 先安装devtools包 install.packages("devtools") devtools::install_github("BioinformaticsFMRP/TCGAbiolinks") 如果你对TCGA数据挖掘有兴趣的话，可以学习我们的TCGA相关...
...术在肿瘤中日益广泛应用，肿瘤组织的基因测序及DNA序列分析已经不是瓶颈。基因研究的重点已从结构转向功能，技术需求同时对多个患者的肿瘤样本在同一水平进行免疫组织化学染色及原位杂交等操作。 传统的肿瘤组织切片...
...的内容，下载了水稻的GES = "GSE27856"，GPL = "GPL2025"）进行分析，按照课程所给的R语言代码进行（除了改动GES号和GPL号）；按照代码生成基因表达数据后（GSE27856expressionMatrix.csv）遇见了一个问题：表达数据（GSE27856expressionMatrix.csv...
...是个技术活 在各家测序公司的努力下，现如今转录组的分析结果是越来越丰富了，提供的结果里是文件夹套文件夹，总共几百个文件，还都是英文名。这对于不熟悉转录组分析结果的同学来说，想找到自己想要的文件实在不容...
...生。这会带来问题。无法在不完整的数据矩阵上进行聚类分析。 Husson和Josse写了一个称为missMDA的包，可以用imputePCA（）函数进行缺失值的填充。 library("missMDA") df=read.table("aa.txt",header = T,row.names = 1,sep="\t") df=log1p(df) res.comp &...
在利用咱们的GWAS分析课程进行感兴趣的区域LD热图绘制时，显示warning skip Indel site, there are total skip Indel sites number is : 105。 因为我的vcf文件中同时包括了snp和indel变异信息，有些indel位点与表型是显著关联的，我想保留indel位点，...
...网站系统环境：操作系统：win10教育版，docker：docker桌面版本 docker学习安装使用课程见： https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0 1.下载组学大讲堂提供的专门为GSDS定制的docker镜像 > docker search omicsclass #搜索镜像NAME ...
...！ 下图即为文章中R2R3-MYB基因家族和其他物种进化关系分析图，图中共包含油菜、白菜、甘蓝以及拟南芥四个物种的MYB家族基因，接下来我们就一起学习一下这四个物种基因组进化关系（共线性分析）到底有什么特别之处，以...
... （图为：CORNERSTONE项目动态实时更新页面） 项目异常分析 当任务完成率较低或任务延期率超过预期的话就要及时调整策略或制定相应的应急计划来进行补救。 如果是团队负责人就要看一下是团队成员工作量安排超负荷还...
...ere 列 = any() 括号中任意一个 all(): where 列 = all() 列匹配里面所有 在一个select语句中嵌套另一个select语句 子查询分为: 标量子查询：子查询返回一个数据（一行一列） 列子查询：子查询返回一个列(多行一列)...
老师，我再做谷子SV与一个基因家族的保守 结构域分析时，首先找到了最多SV overlap的家族基因的品系，找到了L30（它有15个变异，有几个其他基因组是14个），发现它和参考基因组之间10条logo图，只有一条没有对的上，正确 吗，...
老师我在做基因家族成员选择压力分析时，得到了all_kaks之后，下一步该绘制kaks密度分布图，使用脚本Rscript /work/scripts/kaks_plot.r -i all_kaks -p kaks --xlab ka/ks --min 0.05 --max 3 -H 10，之后会提示如下错误， 尝试安装包时候出现错误# 设...