... -t 文件中生存时间列名，默认为TIME -p 根据生存数据划分的训练集与测试集之间的比例，默认为6：4 -o 输出文件路径 -n 指定输出文件名字 使用举例：Rscript split_sample.r -i ../project/zx-20210908-381-TCGA_CHOL/01_meta/surviva...
...与丰度展示稀释曲线 微生物多样性分析中需要验证测序数据量是否足以反映样品中的物种多样性，稀释曲线（丰富度曲线）可以用来检验这一指标，并间接反映样品中物种的丰富程度。具体方法为:利用已测得16S rDNA序列中已知...
...章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提...
Pacbio 的测序原理与二代的边合成边测序原理有很大的不同。其在建库上就有很大的差别。 二代的测序文库是线性的，而三代的测序文库是环装的。 环装的文库，有很多的好处： 1. 环装结构，使得测序能一直测序下去，充分利...
...示不同转录本的结构差异。ggbio是基于ggplot2开发的基因组数据可视化专精包，特别适合处理基因组坐标数据。它够直接处理GRanges对象（基因组范围对象），与Bioconductor生态系统完美契合。 先来看看最终效果！ R包安装 通常...
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具体来说我想用plink删除基因组上连锁不平衡的位点，但我两份数据的位点数不一样，用同样的参数可以得到同样的连锁不平衡位点的集合吗？
...http://hmmer.org/download.html ，主要用到hmmsearch,已经来自pfam数据库的隐马尔可夫模型。记住模型下载是在pfam数据库中，选择你自己需要的模型即可，如若没有你需要的模型怎么办呢，这时我们可以自己建立模型，请看图3后一行码。...
...fasta序列，如果你知道基因的GI或Accession号，也可以直接数据这些ID就可以查询，右方OPTIONS中选择要搜索的数据库，Expect Value等，或者使用默认设置，然后按“提交”按钮。就可以搜索了； 3.结果查看，默认为concise 简洁显示，...
我有一个包含300份材料的自然群体，群体的重测序数据也有，但是表型数据只有两百多个材料的，我需要对重测序的vcf文件进行修改，剔除没有表型数据的材料的重测序数据吗？
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...图片引自 Chen HF, et al. 2019 视频课程推荐： 重测序数据自主分析：https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ群体遗传进化分析https://study.163.com/course/introduction/1212073805.htm?share=1&shareId=1030291076