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问题 加载镜像出问题

docker load -i pop-evol-gwas-v2.0.tar.gz a5ca99798109: Loading layer [==================================================>]  3.072kB/3.072kB open /home/software/docker/overlay2/97f7231d70280dafd0d38fa35f012c1eb35b2f2eec9aa6465adce7b47edfc598/.tmp-committed1222550407: no such file or directory ...

问题 请问Evolview网站是不是不能用了？怎么打不开啊？

https://evolgenius.info//evolview-v2/#login这个网站打不开啊？？？？

文章 多种进化树编辑处理软件

...多方面的方法、软件等知识，感兴趣可以多了解一点。 2、http://www.treedyn.org/Tree_editors.html 这一网站也提供多种常见和主流的系统进化树编辑处理工具的链接。

问题 物种间共线性分析染色体不显示字母

在做物种间共线性分析的时候，画出来的图中染色体不显示字母怎么解决，配置文件如下 图1：bed文件 图2：mcscan_seqid文件 图3：mcscan_layout文件 图4：

问题 没有转录组数据能进行基因家族分析吗？

...不是太大，可以选择用实时定量进行表达模式变化分析；2. 可以下载其他人上传至NCBI上的数据，只需研究性状及实验设计符合即可，只需跑个流程分析一下就可以了。

文章 低成本转录组跨种遗传进化分析

...A. danaeifolium Langsd. & Fisch., A. aureum L. and A. speciosum Willd2 。这三种蕨类又具有不同环境的适应性，且金蕨属是唯一生长在潮汐带上的蕨类，在蕨类植物中占用特殊的地位。作者通过重建该属的系统发育和估计分歧时间，在分子水...

问题 [名词解释] 分子连接？

...物活性之间定最关系(亦即构效关系或SAR)的一种方法。 2.实验技术文献中提及生物分子连接/探针分子连接。 3.ADC和生物偶联，生物偶联涉及将“分子连接”在一起。 不清楚是否有其他相关的解释场景？

文章 安装R包的几种方法

...led.packages() #查看已安装包install.packages("packageName") 2.找到R包下载地址后安装 url <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/rvcheck/rvcheck_0.1.8.tar.gz"install.packages(url,repos = NULL,type = "source") 3.R包下载到本地后安装 download.file("ht...

文章 docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault

解决办法：1.加大docker的内存：https://www.omicsclass.com/article/1413  2.可能由于编译plink软件的系统和运行软件的系统不同，也就是内核不同可能导致segmentation fault，  这种原因是系统原因的问题只能换个电脑试试；

问题 求助大佬，使用服务器分析基因家族问题

...x系统下构建进化树软件推荐，Linux有非图形化的mega吗？ 2.  怎么在没有root权限情况下安装perl模块？如果有基因家族分析的脚本中需要的模块有个名称汇总就更好了

问题 请问在用SURVIVOR进行多样本SV合并出错

在用SURVIVOR进行多样本SV合并时，生成的合并vcf里只保留了两个样本的信息，命令如下SURVIVOR merge sample_files 1000 2 1 -1 -1 -1 group_merged.vcf，sample_file里包含manta和delly鉴定出来的SV

文章 ssGSEA.r 单样本基因集富集分析

...expset                        input gene expression set matrix from RNA-seq data csv                        format [required]  -g geneset, --geneset geneset                        input gene set database [required]  -o outdir, --outdir outdir             ...

文章 python2运行lefse软件的时候报错

使用python2运行lefse软件的时候报错这是因为当前LEfSe依赖的R包rpy2的版本与你的R版本不兼容，你可以尝试更新一个rpy2的小版本，比如我更新了 pip2 install rpy2==2.8.6 随后就可以直接使用

问题 QTL-seq分析问题

...1）给出结果中95%和99%的置信区间具体是怎么计算的？（2）候选基因是在超出阈值线的区域吗？如果都没有超出，该如何解决，能否适当降低阈值，比如设90%置信区间，该怎么计算。（3）能否给出上面这个图的代码呢，大部分论...

文章 git 的基本使用

...设置端口为880， 输入自己的用户名和密码 git clone http://192.168.1.100:880/root/rna_seq.git 2. 拉取master 分支 git pull master 3. 创建新分支，用于更新代码 git branch newissue git checkout newissue 4. 修改代码，并递交 git add . git commit -m '修改记录...