R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题，相关解决方法： 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况（MB） 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memory.size()[1] 94.2> memory.limit()[1] 8081 3、ls() 查看当...
二叉树是一种非常重要的数据结构，它在计算机科学和软件工程中有着广泛的应用。本文将对二叉树进行简要介绍，并给出几个实际应用的例子。 一、二叉树简介 二叉树是一种树形数据结构，其中每个节点最多只有两个子节...
老师您好，返回来的数据说是双端测序，但是sra转为fq文件只有一个，询问得知是合并了之后。这个要怎么处理，没办法生成脚本里面的qza和qzv文件
关于物种组成数据Hellinger的转化 一般而言，对于物种组成数据较少使用PCA这种线性模型去做，PCoA或NMDS等是比较推荐的。 如果仍要使用PCA的话，事实上，并不是说物种多度数据一定要作转化才行。如果物种多度数据比较均匀，...
我选择了一个基因在NCBI上面搜索，得到了对应的基因，identity conserved domain 得到 点击进去得到的跟您那个NB-ARC的例子不一样 显示这样的，我搜索的domain 是一个超家族的成员，那么再进去是这个超家族的pfam号，这个号可以用...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
我做的物种是水貂，一个非模式物种，有参考基因组。 按照课程中和的指示，下载了基因组信息（ensembel）。在进行GO 和KEGG注释时，使用蛋白序列作为基因代表序列用于同源注释出错，如下。 gff3文件内容： pep.all.fa文件内...
...rived Xenograft Tissue XCL99sample type 99 99SH 如果您对TCGA数据挖掘感兴趣，请学习我的TCGA系列课程： 《TCGA-生存分析》《TCGA-基因差异表达分析》《TCGA-转录因子调控》《TCGA-ceRNA调控网络分析》
... 结果解读 1.如果参数中路径没有额外设置，那么在原始数据同级目录下会得到搜库结果：其中，mqpar.xml是所有参数配置文件，若二次搜库，可直接导入MaxQuant中，无需重复设置。所以，一般建议保留下来，这样也可对结果的设...
数据介绍：拟南芥叶处理DC3000和对照control两个样本： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213622 数据下载 这里我们下载圆圈2的数据 wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE213nnn/GSE213622/suppl/GSE213622%5Fcoaker%5Fatpst%5Fsin...
加载相应的R包与数据设置 library('ggplot2')########################画图library('reshape2')########################meltlibrary('grid') ########################分面A =rep( c("A","B","C","D"),each=2)B = c(6.332968,9.368328,6.674348,4.127901,5.192845,6.652865,7.829350,6.995062)C = c(5.3...
...但是对于生信小白来说就难上青天了；不过还有一些在线数据库是可供我们查找提取启动子序列之用，常见的比如NCBI，ensembl，UCSC 等等；但小编觉得那些都不怎么好用，上周我们其实给大家分享过一个非常好用的植物启动子分...
请问从http://firebrowse.org/?cohort=BRCA&download_dialog=true 下载的甲基化数据，里面的甲基化探针cg号转换为基因名？
了解虚拟变量 DUMMY VARIABLE 在数据分析中，利用回归模型来寻找变量间的关系是广泛应用的一种数据分析方法。通常情况下，回归分析中变量都是定量数据，原因是模拟回归需要样本数据。然而在实际的操作中，模型中只考虑定...