问题 使用RNA-seq有参转录组课程提供的demo数据，进行参考基因组索引建立后与老师得到的结果不一致

如题，使用RNA-seq有参转录组课程提供的demo数据，进行参考基因组索引建立后与老师得到的结果不一致，请问是什么原因？我得到的没有5和6，而且1和2是空文件。

文章 单细胞转录组数据标准化：

...序深度的归一化，从而促进更相似的细胞间比较。然而，数据需要进一步缩放，以稳定基因表达水平和方差之间的关系。ScaleData 采用简单的基因水平居中和缩放，这意味着每个基因的均值中心为零，表达值按标准差缩放。生成...

文章 STRING蛋白互作网络图绘制及子网络分析

...PTEN相关的差异基因（lncRNA、mRNA、miRNA），接着通过各种数据库来分析预测基因之间的相互作用来构建ceRNA网络。 互作网络的绘制 为了使大家能更简便快捷地绘制出精美的互作图，这里我们给大家提供一个绘制网络图的R脚本...

问题 tassel导入表型数据和Q文件，一直报错格式有误

ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Problem loading file: /home/liuyunxiu/GWAS/intersection_data/sorted_shared.corrected.Q.   Error: Unrecognized format for a phenotype. [pool-2-thread-2] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Problem loading file: /home/liuyunxiu/GWAS/...

问题 基因组数据版本更新导致无法根据旧的蛋白ID或基因locus提取相应序列，如何解决？

...该蛋白进行blastp， 由于文献是2015年的， 根据文献补充数据给出的蛋白ID和locus号（下图左），已经无法匹配现有的蛋白序列文件（下图右）了，老版本蛋白序列文件已经删除，只剩cds和gff文件。 新版本的基因和蛋白ID命名与...

问题 请问老师，9个g 的重测序数据能不能用自己电脑的linux 系统进行分析啊，进行snp 变异检测！！！

问题 你好，老师，能用R语言软件分析GEO数据库中关于lncRNA、microRNA及DNA甲基化表达芯片吗？

问题 【NCBI传数据aspera】老师请教一下，在Mac的终端里，这段命令没有反应，也想不到解决办法了。

问题 hisat2软件做转录组数据比对时出现的一个报错，百思不得其解，求各位大佬帮忙看下

问题 用tassel软件输入的表型数据是质量性状时输入格式是和数量性状一样吗？用0和1进行赋值

问题 老师，我看您之前分享过一个HGMD数据库的下载链接，但是现在似乎失效了，请问能再次分享一下吗？

问题 GWAS课程中LD分析使用示例数据一直做不出来，检查很久都没有解决问题，麻烦老师进行解答。

问题 请问一下你们在动植物比较基因组中准备数据中使用的代码脚本运用到哪个软件，具体操作是什么？？

问题 binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢

问题 老师，进行结构变异分析时得到了tsv数据，请问需要转变为vcf文件吗？如果需要的话如何转变呢？