...[输入文件...] 其中每个[选项]所代表的意思如下： -e script: 允许直接在命令行中提供编辑脚本。-f script-file: 从指定的文件中读取编辑脚本。-n: 仅打印经过sed处理的行，而不打印原始文件中的未修改行。-i: 直接修改文件内容，...
...有患者在样本采集前均签署了知情同意书。总共使用了 4 个癌旁组织（N）、4 个早期甲状腺癌（乳头状甲状腺癌）样本、4 个局部晚期甲状腺癌样本和 4 个间变性甲状腺癌样本进行空间转录组学分析。4 个癌旁组织样本中的 3 个...
...菌，取未处理的作为对照组（CK），对照组和处理组各三个生物学重复。 02/研究方法 作者主要采用了三种实验技术：第一种是蛋白质组学分析（iTRAQ）；第二种是显微镜检测（明视野显微镜和荧光显微镜）；第三种是酶活检测...
Kaplan-Meier法是现如今生信分析最常用的方法之一，先通过计算出活过一定时期的患者再活过下一时期的概率（即生存概率），然后将逐个生存概率相乘，得到相应时段的生存率。基于这一方法，绘制出KM生存曲线能够直观展现分...
老师我在做KEGG富集分析的时候，用了459个下调的差异基因进行富集，结果得到的通路P值都＞0.05，老师这种情况会发生吗？原因是什么，我要怎么样调整参数才能得到p值小于0.05的通路？
...价值，目前广泛分布于亚洲、大洋洲和美洲，存在2000多个种，而在中国有超过7000年的驯化历史。目前对莲的研究集中于产量及观赏价值，对其种群历史以及与灭绝和适应相关的进化问题研究很少。 2022年武汉大学生命科学学院...
... print(p) 而由结果图片明显能知道shape有效的映射，仅6个，前六个因子有效，而之后的因子并不能出现其他shape（对应因子“0”、“1”，“2”...而不是数字0、1、2...） 故在进行数据整理的过程中需要注意基于shape进行映射对...
...被另一个模型替代后信息的丧失。因此，AIC值较小的模型更好；BIC（Bayesian Information Criterion, BIC）：值越小，模型与数据拟合度越好；DT（Decision Tree，DT）将测量系统发生性能的相对分支长度误差整合到模型选择过程的方法。总...
...和John T. Curtis的名字命名的主要基于OTUs的计数统计比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离包含的信息完全不一样相比于jaccard距离Bray-Curtis则包含了OTUs丰度信息。其中S_(A,i)和S_(B,i)表示第i个OTU分别在A群落和B群落中的计数...
老师您好，我有两个问题。我的转录组测了两个物种，各3个发育时期A，B，C，发育时间顺序是A到B到C一个连续的时间顺序。两个种是同科的，相对近缘。筛选差异基因的阈值相同，都选定为FDR<0.05 且 |log2FC|>1，即两倍的差异...
距离2020年研究生考试还有2个多月的时间，在这种最后冲刺的关键阶段， 每年都有各种各样“花式备考”新操作出现： 有为了省时间“不洗头”的： 有上演各种“花式占座”的： 有在朋友圈转发锦鲤的： 还有怒...
...蛋白ID之间都是没规律的。蛋白ID、基因ID、mTNA ID前面几个字母分别以P、G、T结尾，这个很容易解决。但后面的11位数字编码却毫无规律可谈，蛋白fa文件中，蛋白ID后面有“gene：”、“transcript：”的对应关系注释（图1）。cds的fa...
...小时完成300个单词，我们的大脑在完成小的简单任务时会更好地工作，然后，分配时间以切合实际的时间表完成活动。1小时内写300个单词对你来说太多?那你可以花改成花两个小时完成，然后一步一步调整，最终实现这个目标。...
... 15这一步，因为测序的物种是15条染色体，但运行后只有1个group出现：sample.clean.counts_GATC.15g1.txt，没有出现预期的15个group,请问是什么问题？谢谢
在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候，需要四个文件： 1、基因表达数据文件； 2、表型数据文件； 3、功能基因集文件； 4、芯片注释文件； 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即可，因为GSEA网站已经给大家...