string数据库下载的文件表头比较复杂,我给大家写一份说明书 1,neighborhood_on_chromosome: 这个特征表示在基因组中,两个基因是否靠近彼此,通常使用染色体上的物理距离来确定。如果两个基因在某些物种中距离非常接近,那么...
> gset <- getGEO('GSE95394', destdir=".", + AnnotGPL = T, ## 注释文件 + getGPL = T) ## 平台文件 Found 1 file(s) GSE95394_series_matrix.txt.gz Failed to open file C:\Program Files\R\GSE95394_series_matrix.txt.gz.curltmp.File stored at: ./GSE95394_se...
...ds -out dbname -title dbtitle -logfile filename 参数说明: -dbtype:数据库类型,prot或nucl -parse_seqids:解析序列标识(建议加上) -out:数据库名 -title:数据库名(略) -logfile:日志文件,默认输出到屏幕更多参数 makeblastdb -help 蛋白序...
数据介绍:来自谷歌翻译:对癌症的免疫反应差异很大,特别是与错配修复缺陷(MMRd)的结直肠癌肿瘤相比,错配修复良好的肿瘤表现出免疫细胞的存在和活性升高。为了了解免疫反应模式以及这些类型结直肠癌之间的主要差...
数据库下载: http://eggnog5.embl.de/download/emapperdb-5.0.2/ http://eggnog5.embl.de/download/ $ md5sum eggnog.db eggnog_proteins.dmnd #下载完成之后核对md5值065763df8f1593dc6d08c5ce06401fcf eggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd eggnog_proteins.dmnd 利用docker...
...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
...e 2, Traits data collected in multiple environments: 参考文献中示例数据:https://www.nature.com/articles/ng.3807#Sec32https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fng.3807/MediaObjects/41588_2017_BFng3807_MOESM68_ESM.xlsx
InterPro是一个数据库,它集成了许多数据库关于蛋白质功能的预测信息,概述了蛋白质所属的家族及其包含的结构域和位点。InterProScan是InterPro数据库提供给用户的一个软件包,以集成的方式从InterPro数据库中进行结果检索。InterP...
10x的数据可以使用 cellranger mkfastq 产生,下面的例子是两个样本同一个lane测序拆分后分析;第二个例子是同一个样本两个lane测序,需要合并一起分析; 大家注意文件命名方式,蓝色和红色部分; spaceranger命名规则 [Sample Name]...
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
老师,请问一下我在进行WGCNA分析时,将原始数据的基因位置改变之后,分析得到的关键基因就变了,请问一下这是怎么回事啊?
导入了最新的内切酶,我的Excel数据导入哪里
...后来,经查sed官方用户手册,才得知,sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline,其实就是行的分隔符即换行符。 如果非要使用sed命令,实现替换file文本内容的换行符为空的话,那么...
请问各位大虾 比如我想要第一条染色体上的A 和第二条染色体上的B 这两个基因, 想用红色去表示, 如何修改配置文件???