我按照教程执行命令，想借此下载自己感兴趣的数据 在执行到GDC下载这一步，突然出现下载数据找不到，而出现下载中断，无法继 还有个问题，查询到的样品数目为何和癌症和癌旁样本加起来不一样。。。。少的去哪里了
做了有十来个数据了，第一次在这里出问题，这怎么处理啊，谢谢各位大佬。
...ackages('pheatmap')#安装R包 library(pheatmap)#加载R包 画图 画个基础图形 Rscript heatmap.r -i fpkm.txt -s -n heatmap绘制图形，并保存文件。 画的图拍你可以根据自己的喜好进行调整，包括横, 纵轴； 颜色，聚类；长宽比例都可以进行调...
老师你好，有个问题我一直不理解。 #删除一些不需要的基因的表达量（B73的一些基因在其他物种中不存在同源基因） perl $scriptsdir/grep_famgene_fpkm.pl WRKY_gene_fpkm.xls ../03.PAV/PAV_gene.list WRKY_gene_fpkm.filter.xls ${ref} 以上这个命令。 1....
...任务运行怎么出错？命令是nohup ParaFly -c work285.sh -CPU 8 > work285.sh-4.o& ， 而不用并行命令 直接运行nohup sh work285.sh >work285-3.sh.o& 这个命令就不报错，这是怎么回事？ sh: -I: command not found warning, cmd: -I $workdir/3.map/re...
前面几个步骤都没问题，出来的文件也都正常，也检查了全局变量，请问该怎么改？
...基因家族的HMM模型，搜索物种的蛋白质数据库，得到了10个该基因家族的基因， 但是拿到ncbi和pfam去做蛋白质结构域检测，发现，这10个基因的结构域除了都只含有同一个结构域，没有包含其他的结构域了，这正常吗？ 是我在...
...用说明： 使用方法类似于基因表达量多因素cox分析https://www.omicsclass.com/article/1533 ，但这个脚本支持输入临床数据用于模型构建并绘制列线图，列线图用的R包rms； $Rscript $scriptdir/nomogram_multi_cox.r -husage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_im...
...得出的均方，F值为两个均方的比值（效应项/误差项），P值为显著性。 以上就是使用Excel 2010软件进行单因素方差分析方法的介绍。在“网易云课堂”上搜索“组学大讲堂”有更多精彩教程视频供您观看学习。 更多生物信息课...
...疗方法。 文章： 分析思路： 数据介绍： 来自GEO两个表达数据，包括AMD患者和正常对照： 主要结果： 1.两个数据集，分别以患者和对照为分组筛选差异基因： 2. 共有的差异表达基因（107个）表达热图展示: 3.差异表...
1.下载数据： #wget -c https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/taxdump.tar.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2acc_lmdb.db.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2accession.py#wget -c https://ftp.ncbi.nih.gov/blast/...
我们课题组研究的物种，基因组质量不太好，所以做转录组的时候想按有参、无参都分析一遍，最近想买个服务器，不知道应该按什么标准去买了
...答，有些问题想跟您请教：在绘制微观图时，我用的是六个物种的基因组，看它们共有的一个家族基因的共线性，block文件如图所示 但是这里它涉及了多个物种的多条染色体，在做layout文件的时候我有点犯难了，我想要的效果...
CORNERSTONE最近在知乎看到一个关注度很高的问题“小公司如何管理好团队？”题主列举了一系列十几人的小团队目前面临的问题，无外乎： “如何让你的团队跟你是一条心做事，大家劲往一处使？”“我不在的时候，其他人...