找到约 15 条结果

文章 实验室linux生物信息服务器搭建CentOS7

...服务器选择: 海量的高通量测序数据,windows是处理不了的。因此果断选择linux服务器,开源免费而且生物数据分析软件也免费。这里选择CentOS版本的linux作为服务器的操作系统。 Ubuntu系统适合安装到个人电脑。 下载地址...

问题 多序列比对建树及保守结构域分析

...问题,不同物种之间同源蛋白序列进行多序列比对时,是保守结构域进行比对比较好,还是全部序列比较好?因为很多序列是从NCBI上下的,不能保证其序列的完整性。而且出来的比对图非常长,不好往文章里放。如果这...

文章 前沿科普:间充质干细胞的研究为什么这么火?

...的免疫调节特性,间充质干细胞赋予了它在人类疾病治疗的巨大潜力。 间充质干细胞的研究有多热门?数据告诉你! LetPub数据显示,2019年国家自然科学基金项目,关于间充质干细胞的项目共132项,总资助基金达5564.7万...

文章 R语言绘制频数、频率分布直方图

R语言hist函数 可于绘制直方图,具体法如下: n<-round(runif(1000,0,100))  #生成0到100的1000个随机数 hist(n)      #频数分布直方图,纵坐标名字为frequency hist(n,freq = F)   #频率分布直方图,纵坐标名字为density 选项设置...

文章 基因编辑RAW264.7细胞系—助力炎症以及破骨细胞生成相关研究-源井生物

... CRISPR/Cas9介导的miRNA-155敲除模型,帮助探究类风湿关节炎可抑制RAW264.7细胞产生促炎细胞因子 据报道,类风湿关节炎(RA)影响着全世界2100多万人。RA是一种影响关节的自身免疫性炎症疾病。它的特征是巨噬细胞和淋巴细胞浸...

问题 您好,我想请教一下为什么evolview美化进化树时,总是出现 error: error: at least one valid colorset data should be given; data not upload/ updated 这个提示呢

问题 我按照视频里的方法deblur的方法进行分析,输入了51个样本,但是最后就剩下了35个样本,如图所示,请问是那一步出现错误了,是 数据有问题还是写的参数有问题

问题 我按照视频里的方法deblur的方法进行分析,输入了51个样本,但是最后就剩下了35个样本,如图所示,请问是那一步出现错误了,是 数据有问题还是写的参数有问题

问题 R可视化snp分布的时候出现错误:WARNING: ignoring environment value of R_HOME Fatal error: cannot create 'R_TempDir'

# Rscript $scriptdir/var_density.R -i snp.unknown_multianno.vcf  -b 1000000 -c "darkgreen,yellow,red" -t "SNP Density" WARNING: ignoring environment value of R_HOME Fatal error: cannot create 'R_TempDir'

文章 AI助手帮我整理GEO数据库样本信息表格

...不已,它所展现出的强大能力着实震撼人心。在实际工作,借助大模型作为得力助手,能够显著提高工作效率。接下来,我将以数据整理为例,和大家分享一些经验,希望能起到抛砖引玉的作。 在生物信息学领域,从 GEO(...

文章 linux字符串截取

... # 号截取,删除左边字符,保留右边字符。echo ${var#*//}其 var 是变量名,# 号是运算符,*// 表示从左边开始删除第一个 // 号及左边的所有字符即删除 http://结果是 :www.omicsclass.com/123.htm2. ## 号截取,删除左边字符,保留右边字...

文章 gdc-client 下载TCGA数据

...太稳定,导致TCGAbiolinks 软件包无法和服务器链接,下载不了数据。遇到这种情况,只能采GDC Data Transfer Tool(gdc-client) 下载数据了。下载方法可以参考如下:   1. 安装gdc-client 软件 该软件支持在Windows, Linux, Mac OS 等不同操作系...

问题 老师你好,我在紫花苜蓿的全基因组数据库通过Blast比对得到76个WOX家族基因,这76个基因的序列都是不同的,但有的很相似,可能是同源基因,去冗余

文章 PubMed文献按影响因子排序

...活 最关键的一步就是制作过滤器: 首先,随便在pubmed搜素一下找到:manager filters 点击进入(在右下角红框框处),当然我的IF已经设置好了。 其次,进入之后按下面步骤建立filter,关键为step2 制作过滤条件: 在st...

问题 基因组组装BUSCO多拷贝过高

物种流式做出来是3.6G左右,kmer估计也是3.6G左右,HiFiasm默认参数组装也是3.6G,但是BUSCO的D数目过高,|C:99.2%[S:3.1%,D:96.1%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614 。这个是什么原因呢?后面需要怎么操作