...服务器选择: 海量的高通量测序数据,windows是处理不了的。因此果断选择linux服务器,开源免费而且生物数据分析软件也免费。这里选择CentOS版本的linux作为服务器的操作系统。 Ubuntu系统适合安装到个人电脑中。 下载地址...
...问题,不同物种之间同源蛋白序列进行多序列比对时,是用保守结构域进行比对比较好,还是用全部序列比较好?因为很多序列是从NCBI上下的,不能保证其序列的完整性。而且出来的比对图非常长,不好往文章里放。如果用这...
...的免疫调节特性,间充质干细胞赋予了它在人类疾病治疗中的巨大潜力。 间充质干细胞的研究有多热门?数据告诉你! LetPub数据显示,2019年国家自然科学基金项目中,关于间充质干细胞的项目共132项,总资助基金达5564.7万...
R语言中hist函数 可用于绘制直方图,具体用法如下: n<-round(runif(1000,0,100)) #生成0到100的1000个随机数 hist(n) #频数分布直方图,纵坐标名字为frequency hist(n,freq = F) #频率分布直方图,纵坐标名字为density 选项设置...
... CRISPR/Cas9介导的miRNA-155敲除模型,帮助探究类风湿关节炎中可抑制RAW264.7细胞产生促炎细胞因子 据报道,类风湿关节炎(RA)影响着全世界2100多万人。RA是一种影响关节的自身免疫性炎症疾病。它的特征是巨噬细胞和淋巴细胞浸...
# Rscript $scriptdir/var_density.R -i snp.unknown_multianno.vcf -b 1000000 -c "darkgreen,yellow,red" -t "SNP Density" WARNING: ignoring environment value of R_HOME Fatal error: cannot create 'R_TempDir'
...不已,它所展现出的强大能力着实震撼人心。在实际工作中,借助大模型作为得力助手,能够显著提高工作效率。接下来,我将以数据整理为例,和大家分享一些经验,希望能起到抛砖引玉的作用。 在生物信息学领域,从 GEO(...
... # 号截取,删除左边字符,保留右边字符。echo ${var#*//}其中 var 是变量名,# 号是运算符,*// 表示从左边开始删除第一个 // 号及左边的所有字符即删除 http://结果是 :www.omicsclass.com/123.htm2. ## 号截取,删除左边字符,保留右边字...
...太稳定,导致TCGAbiolinks 软件包无法和服务器链接,下载不了数据。遇到这种情况,只能采用GDC Data Transfer Tool(gdc-client) 下载数据了。下载方法可以参考如下: 1. 安装gdc-client 软件 该软件支持在Windows, Linux, Mac OS 等不同操作系...
...活 最关键的一步就是制作过滤器: 首先,随便在pubmed中搜素一下找到:manager filters 点击进入(在右下角红框框处),当然我的IF已经设置好了。 其次,进入之后按下面步骤建立filter,关键为step2 制作过滤条件: 在st...
物种用流式做出来是3.6G左右,用kmer估计也是3.6G左右,用HiFiasm默认参数组装也是3.6G,但是BUSCO的D数目过高,|C:99.2%[S:3.1%,D:96.1%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614 。这个是什么原因呢?后面需要怎么操作