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文章 清华学生是如何度过大学4年的

...习教室也会人满为患。用一位美国教授的话说:“Students of Tsinghua,no Saturday,no Sunday,no holiday!”就是这种精神铸造了清华的神话。不这样就很难考上清华。 有的同学可能会说:你说的很对,但是我们很难让自己坚持下去,...

文章 植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

...因的相关表达数据等;第四列是则是描述信息,第五列是Type。整个文件中。重要的是前四列内容。 针对非模式植物的基因,需要进行功能注释分类,得到对应的mapping文件。注释工作,可以利用网站提供的在线注释工具进行(...

文章 circos-基因组圈图绘制软件基础绘图

...厚度    thickness=0.03r    #染色体厚度</ideogram>karyotype=/share/circos/result/chr.info  ##核型文件位置#######此处仅显示针对标签text进行设置<plots>    <plot>        type=text  #限定plot为文本标签        color=red  ...

文章 docker在windows系统和mac系统中安装

...载地址: https://www.docker.com/get-docker 点击 Download Desktop and Take a Tutorial,并下载 Windows 的版本: 根据不同的平台下载对应的版本: 下载stable版本: 3、运行安装文件 双击下载的 Docker for Windows Installer 安装文件,一路 Next...

文章 小麦MADS-box基因家族文章 new phytologist(7分)

...:MADS和K结构域所对应的pfam数据库中的号分别为:PF00319 and PF01486,作者利用pfam号在小麦基因组中查找MADS-box家族基因,一共鉴定出201个 M-I-K-C 家族成员。家族成员根据进化树分成15个亚类,同时也添加了水稻和拟南芥当中的MADS-b...

文章 Samtools截取基因组序列(Docker篇)

...      0omicsclass/sratoolkit          SRAtoolkit v2.10.3 and aspera v3.9.9.177872     0 下载镜像。 $ docker pull omicsclass/samtoolsUsing default tag: latestlatest: Pulling from omicsclass/samtoolsab5ef0e58194: Already exists417469905807: Already existsed...

文章 研究miRNA必备的分析网站汇总!

...守的8mer和7mer位点来预测靶基因。 http://www.targetscan.org/miRandamiRanda是John等于2003年5月开发的第一个miRNA靶基因预测软件。miRanda适用范围广泛,不受物种限制,同时提供了 windows,linux,和macintosh多平台版本,可以下载到本地运行。 ht...

文章 GEO数据库之芯片数据下载

...roduct:hypothetical DeoxyUTP pyrophosphatase/Aspartyl protease, retroviral-type family profile/Retrovirus capsid, C-terminal/Peptidase aspartic/Peptidase aspartic, active site containing protein, full insert sequence///Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clon...

文章 一大波三代文章正在来袭!有没有你滴?

...明这些基因也可能参与丹参酮的合成。 isoform detection and prediction (IDP)分析共得到16241条isoform,其中包括10 323 multi-exon基因, 在这10323个multi-exon基因中有4165 (40%)发生了可变剪接,其中多于15%的发生了多于2种的可变剪接方式。...

文章 基于多数据集分析ANLN在宫颈癌所起到的功能

...献: Leilei X , Xiaoling S , Jizi S , et al. ANLN functions as a key candidate gene in cervical cancer as determined by integrated bioinformatic analysis[J]. Cancer Management and Research, 2018, Volume 10:663-670. 相关课程: TCGA-基因差异表达分析、 TCGA-生存分析 ...

文章 木薯KUP基因家族分析-基因组质量差也挡不住基因家族鉴定分析

...容解读: 1. 木薯中KUP基因家族鉴定 首先,作者从UniPort and RGAP蛋白质收录数据库网站中分别下载拟南芥和水稻中KUP家族基因的蛋白序列作为种子序列建立KUP基因家族基因的HMM隐马尔科夫模型;基于这个模型再利用hmmer搜索木薯...

文章 为什么华为、百度纷纷选择OKR,放弃KPI?

...KR”绩效管理方法。 一、什么是OKR OKR全称是Objectives and Key Results,即目标与关键成果法。它是一套定义和跟踪目标及其完成情况的管理方法,旨在确保员工紧密协作,把精力聚焦在能促进组织成长的、可衡量的贡献上。 OK...

文章 大数据分析 Hbase Shell命令

...ter 'test', {NAME=>'cf2',METHOD=>'delete'} Updating all regions with the new schema... 1/1 regions updated. Done. Took 2.0665 seconds 4. 列出所有Hbase里的表 hbase(main):013:0> list TABLE table ...

文章 必须收藏!比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

...Qingyou Xia, Yi Wang. OrthoVenn2: a web server for whole-genome comparison and annotation oforthologous clusters across multiple species, Nucleic Acids Research, Volume 47, Issue W1, 02 July 2019, Pages W52–W58, https://doi.org/10.1093/nar/gkz333. 日常科研中你我经会常遇到看不懂的...

文章 同是转录组,人家发6分,你为什么发2分?

...成原因,作者分别于种子发芽后第6、7、8天(6 DAP, 7 DAP and 8 DAP;days after planting (DAP))取腋芽组织进行转录组测序,通过对3个时间点基因表达情况进行主成分分析(PCA)发现phyB-1与野生型基因表达模式在6天和8天间分离现象明显...