...n=2.7 anacondasource activate anaCogent5.2 5 配置国内镜像，加快软件安装速度 有时候，安装这些包的速度比较慢，还可能中断，主要原因是Anaconda的服务器在国外。可以换成国内的镜像，加快下载速度。目前清华大学那边提供了镜像...
老师，您好，在对细胞亚群聚类分群之后发现有污染，在进行SoupX去除污染的时候发现有的教程是用的seurat对象RNA表达矩阵里面的count，有的使用的data，这两个要选哪个，如果选了data在去除污染之后重新聚类的时候还需要进行标...
...，如果想要查找某一层面基因表达的数据时，比如组织、细胞等等，在这里ADD想要的type就行。 4、数据下载介绍 选中其中一个感性的标题点击： 之后得到数据介绍页面： 数据介绍及下载详解见：https://www.omicsclass.com/artic...
...个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做更牛的个性化分析，绘更漂亮的图，点这个链接：单细胞/空间转录组分析实操 2. 2区文章...
...测过2019国自然新风向， 其中包括肠道菌群、外泌体、单细胞测序等大热的方向， 另外还有一个就是——CRISPR/Cas9技术，学霸姐姐一直是非常看好的， 4月29日，国自然基金的初审结果已经公布了， 这个预测准不准呢?额，可能...
参考官方文档创建conda环境：https://github.com/aertslab/create_cisTarget_databases 鸭子与人的同源基因创建： 下载的GTF文件中可能包含gene_name这一记录，一般对应的是人类的同源基因，因而可以得到当前物种的基因与人类基因的对应...
老师您好，在做基因组注释时，PASA_assembly中，seqclean报错，使用的是docker的镜像，已添加export USER='me' 报错信息如下： /work/zhushi/04.PASA_assembly/UniVec seqclean running options: seqclean all_transcripts.fasta -c 10 -n 10000 -v ./UniVec Standard l...
安装教程里的代码运行，使用unicycler软件时报错，报错信息如下 == Error == system call for: "['/share/work/biosoft/SPAdes/SPAdes-3.15.4-Linux/bin/spades-core', '/work/my_mt/01.plant_assemble/21.mapped_reads/22.unicycler/spades_assembly/K27/configs/config.info', '/work/my_mt/...
...由SOS2和SOS3激活位于质膜上的SOS1，SOS1发挥转运活性，将细胞内多余的钠离子直接排出体外，发挥抗盐作用。本文对秋茄树中的SOS1基因家族成员进行鉴定，并验证SOS1基因家族在应对秋茄树林生态系统盐度上升和重金属污染时的表...
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读
...3. 镍柱堵了怎么办？ ①样品处理：在样品中可能存在细胞碎片或其他杂颗粒，这些杂质可能会导致柱子堵塞。因此，在将样品加载到柱子上之前，必须对样品进行高速离心处理，以确保只加载纯净的样品。 ②加入蛋白酶抑...
...如何影响物种树的重建。 选择一个合适的直系同源推断软件是特别重要的，特别是在复杂的，存在基因和基因组复制的进化场景中。没有明确考虑这些复制事件的推断方法，如OrthoMCL，被认为在植物相关的分析中存在潜在问题...
...发育阶段表达。miRNA的组织特异性和时序性，决定组织和细胞的功能特异性，表明miRNA在细胞生长和发育过程的调节过程中起多种作用。 二、miRNA数据库 1.miRBase序列数据库是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一，提供公布的miR...
...糖结合和肝素结合相关；KEGG富集结果表明，上调基因与细胞周期、卵母细胞减数分裂和p53信号通路相关，而下调基因作用于黑色素瘤、乳腺癌和肾素分泌（见下图）。 3．差异基因蛋白互作分析为探索差异基因之间的蛋白互作...