...欧几里德距离。权重向量与输入最相似的神经元称为最佳匹配单元（BMU）。BMU 的权重和 SOM 网格中靠近它的神经元会朝着输入矢量的方向调整。一旦确定了 BMU，下一步就是计算其它哪些节点在 BMU 的邻域内。自组织的组成部分初...
老师，我正在做泛基因家族分析家族成员存在缺失分析中，#使用脚本得到存在缺失基因列表和绘图列表——"PAV_gene.list"、"PAV_draw.list" ;以及基因家族编号对应的基因编号的从属列表——"Fam_gene.list"这一步，使用指令perl /work/scripts...
...5年建立。是国际最常用的生物信息数据库之一。 在KEGG分析结果中，总还是有人分不清例如K01000和ko01000这样的编号的生物学意义，下面我给大家再介绍一遍：K01000：由大写K+五位数字组成，对应的是KEGG数据库中某类蛋白的编...
...简称Cox回归模型，有效地解决了对于生存资料进行多因素分析的问题。 但是Cox回归模型在应用时，有一个非常重要的前提条件，即比例风险（Proportional hazards）假定，简称PH假定。 PH假定的基本假设为：协变量对生...
老师我想比较蝶形花亚科的叶绿体基因组，但到目前为止，已经发表的已经有70多种，不可能都进行比较，那如何选择有代表的物种进行分析呢，大概选择几种合适？
...成与动态变化是核心任务。无论是16S rRNA测序、宏基因组分析，还是环境样本的物种丰度比较，研究者常需面对一个关键问题：如何直观展示多个样本在不同分类水平（如门、属、种）上的物种相对丰度？堆叠柱状图以其“多维...
共线性分析中的axt文件，计算Ka时需要把中间的空白和对应的序列删除吗？因为两条序列不等长，我删了之后，还是计算不出结果。 输入命令后得出以下结果： 这是两个序列的相似度，结果如下： 序列中的空白都已经删除...
不然没有办法进行深入的分析啊。我要利用以前发表文献的相关信息来写文章。请问咋解决？只能通过下载和已经发表文献推荐的网址来下载基因组数据吗？
...csclass.com/article/671 视频课程推荐： 重测序数据自主分析：https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ群体遗传进化分析https://study.163.com/course/introduction/1212073805.htm?share=1&shareId=1030291076
老师，我在泛基因家族分析构建系统发育树得到all.domain.treefile文件，将其上传至iTOL,得到下面的图（根在红色圈圈那儿）， 在网站https://www.omicsclass.com/article/343也看到跟我的图类似的结果，我现在的问题是，我的家族成员鉴...
...DNA芯片数据，现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下： M一般做Y轴，A一般做X轴。 M常对应差异表达分析获得的差异对比组之间基因表达变化log2FC A可以利用差异对比组的FPKM进行计算...
...libs/data_table.so) 原因是 /share/work/biosoft/lib/libgomp.so.1库的版本太旧，无法满足data.table所需的GOMP_4.5符号版本。 解决方法将新的库加到环境变量里： export LD_LIBRARY_PATH=/share/work/biosoft/R/R-v4.2.2_meta/lib64/R/library/:$LD_LIBRARY_PATH
...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...
...eters to the function pairs 根据参数解释，可知datME对应WGCNA分析过程中的模块特征向量矩阵 MEs，行对应样品，列对应模块，y为可选设置，如若添加则作为额外的特征向量，与MEs一同整合分析。 同时结合教程可知，y可以作为一...