[root@eff2c0ebb6b8 08:44:02 /work/3.map/vcf]# fst_pi_select_sweep.r --fst F-G.fst --pi1 FS_F.pi --pi2 FS_G.pi --zscore --log2 -A FS_F -B FS_G -c 0.05 -n fst-pi.F-vs-G -f pdf bash: /work/3.map/scripts/fst_pi_select_sweep.r: /biosoft/miniconda/bin/Rscript: bad interpreter: No such file or direc...
...就是从基因表达数据预测表型（即使用癌症基因组计划CGP细胞系数据预测临床结果），预测外部细胞系（CCLE）的药物敏感性，也可用于临床数据的预测。 这个包不能在Rstudio直接安装，需要外部下载压缩包之后导进R。包可以从h...
...要切换到root，这样比较好 请问root会影响环境变量吗？ 怎么调整呢？ 谢谢老师
...n/zip' length 4525485 bytes (4.3 MB) downloaded 4.3 MB 程序包‘lme4’打开成功，MD5和检查也通过 下载的二进制程序包在 C:\Users\陈立新\AppData\Local\Temp\RtmpGgnxVM\downloaded_packages里 Old packages: 'lme4', 'MASS', 'survival' Update all/some/none? [a/s/n]: a 有...
...个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做更牛的个性化分析，绘更漂亮的图，点这个链接：单细胞/空间转录组分析实操 2. 2区文章...
...数据去完成。 如何预估自己所需测序数据量？ 1. 流式细胞仪： 通过测量细胞核的DNA含量来估算基因组大小，1pg=978M； 2. 网站查询： 植物基因组大小查询：https://cvalues.science.kew.org/ 动物基因组大小查询：http://www.genomesize.com/...
老师，我想把镜像复制到自己服务器上使用，使用的是singularity run reseq.sif，为何进入容器以后软件都用不了呢，是哪里出了问题？
... alignment/map format。而BAM就是SAM的二进制文件，也就是压缩格式的sam文件。 那么SAM文件的格式是什么样子的呢？这里给大家简单解释一下。 SAM格式简介 SAM文件由头文件和map结果组成。头文件为注释信息，以@开头，可有可无，就...
官方使用说明：http://resources.qiagenbioinformatics.com/tech-notes/HGMD_Tech_Note.pdf 但是我们需要转换一下，使ANNOVAR能够支持vcf批量注释，转换perl脚本如下： perl ./prepare_hgmd.pl HGMD_PRO_2016.4_hg19.vcf hg19_HGMD_PRO_2016.4.txt my ($dbfile) = $ARGV[0];my ($o...
比如高粱的super，水稻的sy和un，玉米的scoffold
...记在染色体上的相对位置或线性排列图。 理论基础 在细胞减数分裂时，非同源染色体上的基因相互独立、自由组合，同源染色体上的基因产生交换与重组，交换的频率随基因间距离的增加而增大。位于同一染色体上的基因在...