问题 因为现在安装的blast+的版本太高，所以里面没有blastall这个，那基因家族分析中共线性分析的下面这个用到的命令，怎么修改成blastp或者blastn的脚本方式

blastall -i AT_pep.fa -d AT_pep.fa -e 1e-10  -p blastp  -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast 这个命令怎么改成blsatp或者blastn等的命令，这个是比较蛋白吧，应该用的是blastp？如果用blastp的时候，这个命令怎么修改？

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问题 做无参转录组分析，用（讲堂课程提供的）linux系统安装/使用Trinity老有问题

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文章 perl语言——正则表达式

正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式，可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非常强大，基本上是常用语言中最...

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MENA可以在线分析OTU互作网络（共现性网络） 可参考：https://www.omicsclass.com/article/68 或 微生物OTU网络图绘制(Cytoscape) MENA在完成构建网络（Construct the network）之后，可以对网络进行分析（Analyze the networks），其中一项是结合性状...

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... 期: 高速高效全基因组关联分析软件 BLINK | 华人基因组学在线沙龙 (cgmonline.co)

问题 基因组立调出来序列与NCBI上下载序列有差别

最近在做基因家族分析时发现，起初使用虚拟机进行筛选的，而后使用自己的转录组数据分析，相比之前多了几个基因，也就加进去了，使用虚拟机进一步分析了，在后期进行理化性质分析时发现虚拟机从基因组里调出来的蛋白...

问题 你好老师，我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，老是报错。谢谢回答

老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的...