....24.tar.gzcd /minimap2-2.24make 二、Minimap2的使用 Minimap2 是一个通用的序列比对程序，同时适用于二代和三代数据，可将 DNA 或 mRNA 序列与大型参考数据库进行比对。 典型用例包括： 1、将 PacBio 或 Oxford Nanopore 基因组读数映射到...
根据教程运行保留最长转录本的时候，跑了好几个小时，它程序终止了，但是很多跑出来的.longest_isoform.gff3 文件有一部分是有内容，有一部分是空的，现在我要怎么做，可以保留已经跑完的id，然后继续跑没跑完的
...所谓有益，也都只是在特定条件下， 毕竟对于人类20000个基因来说，有6000个是未知功能或者我们知之甚少的。 而那些被媒体/科普人称为的基因突变又大多落在这6000个基因里， 如果哪一天他们潜在的负面作用被发现/产生，我...
这一步提取后只有一个，请问是什么原因，是不是不适合进行泛基因组分析了 示例数据中的好像还包含26个玉米自交系之外的材料
1. 我下载了基因组注释的7个数据库（database.tar.gz.0到database.tar.gz.6），上传到服务器，cat database.tar.gz.* > database.tar.gz后，解压缩失败 2. 我换了一个电脑下载，换了一个硬盘上传，结果也是一样
GWAS关联分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ 全基因组关联分析（Genome wide association study，GWAS）是对多个个体在全基因组范围的遗传变异（标记）多态性进行检测，获得基因型，进而将基因型与可观测的性状，即表型，进...
目录结构windows系统，硬盘分区管理，包含c盘、d盘，每一个盘符下面包含若干个目录，目录中包含不同文件，并有光驱。linux所有设备以目录方式管理(一个光驱就是挂载在某个目录下面)，目录有一个统一根目录 “/”,所有的目...
...制以及阈值设置，之后可根据分析结果，了解venn图每一个区域内注释到的基因的情况。 1、途径1-选中样品，右键选中venn diagrams 在弹出框中选中mapping进行分析 2、在主界面选中show data using venn diagrams, 弹出的窗口中确定样品...
...阵结构类似下方显示结果： > design A BGSM1626001 1 0GSM1626002 1 0GSM1626003 1 0GSM1626010 0 1GSM1626011 0 1GSM1626012 0 1attr(,"assign")[1] 1 1attr(,"contrasts")attr(,"contrasts")$`description`[1] "contr.treatment" 其0 1表示有无，可以理...
在运用Linux系统命令，KA/KS，计算重复串联基因时，出现的duplication_gene文件，应该是A&B，再出现它的重复B&A，但初次之外，我生成的文件，A&B出现后，又出现A&B,且两次数值还不一样
...workdir mkdir dada2 echo dada2 start date cd dada2 qiime dada2 denoise-paired \ --i-demultiplexed-seqs $workdir/demux.qza \ --p-n-threads 1 \ --p-trim-left-f 29 --p-trim-left-r 18 \ --p-trunc-len-f 0 --p-trunc-len-r 0 \ --o-table dada2-table_biom.qza \ --o-representative-sequen...
我有两个水稻的突变体，分别是用EMS诱导突变的，和tDNA插入突变的，目前都构建了F2代，呈现出明显的3:1分离，应该是个质量性状。请问采用什么测序手段能够比较好的做出定位区间呢？
...出现报错： Error in cor(x, y, use = use, method = method) : incompatible dimensionsCalls: corr.test -> cor 到脚本里看发现报错出现在这个函数里： cor.result <- corr.test(A,B,method = method,adjust = adjust) 原因调查： 查资料发现原因如下： 解决办...