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文章 产品/项目经理,有效提高效率的11种方法

...能力。与能力匹配的就是拥有不同的思维方式。 许多微不足道的反射神经所产生的思想,最终导向到某结果或决策。如果能够明确,很显然是可以事半功倍,走向成功的。 当你真正具备了这些思维,面对下一五年甚...

文章 基因编辑RAW264.7细胞系—助力炎症以及破骨细胞生成相关研究-源井生物

...团库。研究者在体外和体内都筛选了家族,并选择了一更好的家族来将mCas9/gNLRP3导入巨噬细胞中,通过破坏巨噬细胞中的NLRP3来改善脓毒症休克,mCas9/gNLRP3诱导的腹膜炎和HFDinduced T2D。研究为CRISPR/Cas9进入巨噬细胞和治疗多种...

文章 用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

...我生成bash命令批量完成: 点击链接查看对话详情: https://www.doubao.com/thread/w19bbe94b644bac3d 给我的命令: #!/bin/bash# 遍历当前目录下所有以 GSM 开头的文件for file in GSM*; do # 提取 _ 到最后一数字的内容 identifier=$(echo "$fi...

文章 蛋白3D结构预测 3D Protein Structure Prediction

蛋白质的结构分为4层次: 初级结构——氨基酸序列;二级结构——а螺旋(alpha-helix),β折叠(β-sheets),β转角,无规则卷曲(random coil)三级结构——三维结构,由模体(motif)和结构域(domain)组成;四级结构——亚基...

问题 求助WGCNA Hub基因选择问题

...此基因在其他模块中的MM值有什么意义吗? 3. 怎么看一基因与其他模块中基因的连通性?(举极端的例子,画一所有模块中基因的共表达网络,不同模块的连接权重怎么找?)

问题 基因组组装后进行merqury评估出现问题

...分单倍型进行了基因组组装,其他结果都不错,就发现两单倍型merqury结果不好,有些染色体结果是0,请问这是什么原因? 还有问题是map运行过程中提示如图2,但是我查看了fai文件(图3),染色体名称似乎没有问题,请问...

文章 组建专属KEGG数据库

...KEGG富集,竟然全,不显著。所以听人劝,试试自己做一自己物种的。 正文: step1: https://www.genome.jp/kaas-bin/kaas_main  KEGG注释的网址 step2:模仿下图填空  ps 上传文件有点慢呀  (找不断网的地方)着急下班就回家再弄吧...

文章 fuzzywuzzy模糊匹配和提取

fuzzywuzzy 使用Edit Distance 算法,是指两字符串之间,由一转成另一所需的最少编辑操作次数。许可的编辑操作包括将一字符替换成另一字符,插入一字符,删除一字符。一般来说,编辑距离越小,两串的相似度...

文章 monocle3分析结果解读

...激或者发育过程中,细胞会在特定条件下进行分化,从一状态过渡到另一状态,表达完全不同的基因集,有的基因被沉默,而有的基因被激活。这些状态通常很难表征,因为想要纯化中间状态的细胞很困难或不可能。但是通...

文章 遗传图构建-SNP标记分型

...上表规则给子代分型了,其中aa代表与父本相同且纯合;bb代表与母本相同且纯合,ab表示杂合基因型;也有这样记录的:a代表与父本相同且纯合;b代表与母本相同且纯合,h表示杂合基因型;也有这样记录的:A代表与父本相同且纯...

问题 因为现在安装的blast+的版本太高,所以里面没有blastall这,那基因家族分析中共线性分析的下面这用到的命令,怎么修改成blastp或者blastn的脚本方式

blastall -i AT_pep.fa -d AT_pep.fa -e 1e-10  -p blastp  -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast 这命令怎么改成blsatp或者blastn等的命令,这是比较蛋白吧,应该用的是blastp?如果用blastp的时候,这命令怎么修改?

文章 为什么华为、百度纷纷选择OKR,放弃KPI?

...的培训经理,你不能说笼统地说“我想让公司的培训做得更好”,而是要提出诸如“2019年12月底之前让员工的培训满意度超过95%”之类的目标。 其次,目标必须是与员工充分沟通后达成的共识。 制定目标的时候,千万不要...

文章 淡黄的长裙,蓬松的头发?拿什么拯救你,我的项目

...M6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzQxMTM3NDkz,size_16,color_FFFFFF,t_70) 为了更好地把控项目的进程,让各任务有序完成,应通过任务的重要度和紧急度来进行优先级的判断。按照轻重缓急进行事项上的安排,能让你更好地把控项目进度,让一切...

问题 circos图配置文件整理疑问

如上图所示,视频教程中老师提醒就是在每文件下的rule中要注意修改,视频中展示的是拟南芥的MADS box基因家族的共线性分析,下方的这rule 就只有几染色体之间的对比,想问下有没有人知道这地方具体怎么修改。是根...

文章 医学突破的先锋--CRISPR介导的HeLa细胞基因编辑 | 源井生物

1952年,Henrietta Lack(HeLa)细胞成为第一可以在实验室中无限传代的人类细胞系,而这些细胞被科学家们标记为“永生的”。研究人员最初是从侵袭性宫颈癌肿瘤中提取出的HeLa细胞。这些细胞在不断供应的营养物质下持续...