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文章 Linux中for循环使用

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

问题 老师您好,我的项目是对一种昆虫的六个同的土著种进行重测序分析,每个土著种只有一个样品,也就是说我一共只对6个样品进行分析,我目前买了咱们群体结构分析的课程,pca分析好像太适用于我这么少的样品,想请问老师我除了群体结构分析里的内容还可以针对哪些内容进行分析呢,老师可以给我推荐一些课程

文章 将进化树+基因结构+motif—1张图全显示

...好用的?其实你用TBtools就可以了! 文件准备 下最新版本的TBtools:https://github.com/CJ-Chen/TBtoolsMEGA构建进化树的结果文件:nwk文件,提供进化树信息相关基因的gff3文件或者gtf文件:提供这些基因的结构信息MEME分析结果文件:me...

文章 产品/项目经理,有效提高效率的11种方法

...的人群复杂多变,往往需要具备较为全面的能力。与能力匹配的就是拥有同的思维方式。 许多个微足道的反射神经所产生的思想,最终导向到某个结果或决策。如果能够明确,很显然是可以事半功倍,走向成功的。 当...

文章 Muscle 进行多序列比对

...的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。有本地版和在线版,在线版网址如下:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/。 使用方法: MUSCLE 使用起来十分方便,大多数情况下用户只需要指定输入输出文件即可: muscle -in seqs.fa -out out.fa...

文章 codex cli 可以无缝接入deepseek模型了

...个客户端形态——Codex CLI、ChatGPT 桌面端、VS Code 的 Codex 插件(Codex IDE extension)——共用同一份配置文件,按本文配置一次,即可在所有形态使用 DeepSeek 模型。 1. 将 DeepSeek 配置为模型提供方 方式一:一键配置脚本(推荐) ...

问题 老师,我正在做泛基因家族存在缺失分析作图作图这一步,前面由于ID.txt与基因家族列表对应上,将ID.txt文件按照基因家族列表前缀进行了修改,并排序,但是得到的PAV_draw.list和PAV_gene.list,确定对对,且作出图

老师,我将ID.txt文件按照基因家族列表前缀进行了修改,并排序,之后进行perl /work/scripts/PAV_list.pl -pangenel foxtail_millet.GRASgene.pan-genes.list -spid new_ID2.txt -unigenel  foxtail_millet.GRASgene.uniq.list -fam GRAS得到的PAV_draw.list和PAV_gene.list,为 , ...

问题 用jcviMCScan进行共线性分析,好消息是图做出来了,坏消息是自己基因家族的基因几乎没有。各位大佬,应该怎样解决啊?他这个和tbtools完全一样

问题 请问pfam号一般都是整数的吗,我看到一篇文章里pfam 号是带小数的,但在pfam数据库里只有整数部分,带小数是版本问题吗

问题 重测序

...的内存了,一个任务分给20G,同时运行5个任务可以把?知道分给20G的内存够够? 这并行运行和直接分给100G 一个任务运行,速度有差别吗? nohup ParaFly -c  w.sh -CPU 5 > w.sh.o&

文章 遗传家系图代表意思以及绘制技巧

...讲解 通过对家庭成员中某种疾病的发病情况进行调查分析可以判断该病是否为遗传病。通过家系调查可以绘出家系图(或称系谱)来显示某种疾病在家族中的传递特点,借此判断该病是否为遗传性疾病及其遗传方式。家系调...

文章 IF=4.3|棉花GT64基因家族的泛基因组分析及对黄萎病的表达响应

...章。” 该文章对8种棉花中GT64基因进行全面鉴定和系统分析,并研究了基因对黄萎病的表达响应。 01 — 家族成员鉴定 文章选取了CottonFGD数据库中8个棉花品种参考基因组,并从Pfam数据库下GT64的隐马尔科夫模型PF09258。通过...

文章 ProteoWizard工具的安装与使用

...oteoWizard     2. 根据自己笔记本电脑的操作系统下对应版本PW.tar.bz2     3. 勾选     4.点击下到本地文件夹 二、软件安装     1. 对下的软件进行解压缩     2. 得到PW软件中众多的分析工具,除了这些现成的分析工具...

文章 最新2区转录组文章!看人家是怎么写的!

...达模式,从冷驯化和春化两个通路关键基因响应时间先后分析,两个生物学过程是相对独立的。 3. 冷驯化和春化反应的加权基因共表达网络分析(WGCNA) 作者进一步利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)分析冷驯化和春化之...

问题 老师您好!我在做生存分析发现一个基因低表达时os低,但为什么使用ESTIMATE却得到免疫浸润高呢,这是太相符,是是哪里错了?