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问题 LD绘图

...i}.stat.gz -output ${i}.ld 数据是50k的山羊SNP芯片,位点有43000snp,做出来的图如下:感觉这图不太正常,是哪参数设置的不对吗?

文章 如何运用项目管理思维制定工作计划?

...项目管理的过程包括了启动、计划、执行、监控、收尾五阶段;那么同样的,我们也可以把工作计划当做一项目来进行管理。 工作计划的启动阶段,要想清楚想做什么、怎么做等这些问题,这时候建议大家使用5W2H原则...

问题 做生信的笔记本什么配置够啊?

最近想买笔记本电脑,顺道做些简单的生信分析,不知道买什么配置够呢?

文章 从原始测序数据开始分析单细胞数据

...ist --stdin data/12-22-3_L2_1.fq.gz \ #                    --bc-pattern="(?P<discard_1&gt;CTCTTTCCCT)(?P<cell_1&gt;.{10})(?P<discard_2&gt;ACGACGCTCTTCGAGTGATTGCTTGTGACGCCTT)(?P<cell_2&gt;.{8})(?P<umi_1&gt;.{12})T{4}.*" \ #                    --set-cell-number=200...

问题 run_pipeline.pl -Xmx30G -importGuess all.clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter 做iqtree分析的时候,转换文件格式报错

问题 老师,提取出来的结构域是下图那样,这条命令应该怎么改:#选择第一结构域进行后续分析 sed -i "s/_.*$/_${ind}/g" ${ind}.UGT_domain1_final.fa

问题 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G \ -m GTR -redo \ -B 1000 -bnni \ --prefix iqtree 命令怎么加入外类群分析

问题 如何用荧光定量验证转录组结果

 问大家一比较小白的问题,用荧光定量2-△△CT法验证转录组log2FoldChange值,合格的标准必须是倍数一样吗,还是大小趋势相同就可以 我验证了六差异基因,请大神帮我解答一下,谢谢

问题 获得共线性圈图时出错

上面是我在获得画图所需四文件后进行绘图的命令操作过程,我用pwd确认了绝对路径,检查了多次觉得没有写错文件路径,但运行命令后还是出现错误提示,请黄老师帮我看看是哪里的问题?谢谢

文章 2020年读研还有用吗?工作 or 读研,到底选啥?

...应的,他们的补贴会更高,今后的就业以及落户福利也会更好。 所以,报or不报,就看你自己了。 有些同学想说,既然不确定,那就报咯, 考不考得上另说,就算考上了,如果到时候有更好的选择,也可以不去读嘛。 的确...

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师您好。我的泛基因组为15品系基因组构成,参考基因组为JG。为啥我WRKY_gene_fpkm.filter.xls的结果缺少SD和RA品系的呢?

文章 singularity运行fastqc报错OutOfMemoryError

... fastqc $datadir/*.gz  -o $workdir/1.fastqc 可能报错: 可以加一-t选项,多线程运行,如下图,指定一下线程,可以在自己服务器允许的情况下,多指定几线程。

文章 利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

...一逻辑单元,用于提供更高的性能、针对驱动器故障的更好的数据安全性和更高的存储容量。也就是多块硬盘组成一大的硬盘这样我们不会因为数据太多一盘存储不下分开好几盘存储,管理起来很不方便。还有一好处...

文章 BSA分析中QTL-seq 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

... ####################################Arg<-commandArgs(TRUE)###########input###############################################individual_analysis<- c(Arg[1])reprication<-c(Arg[2])filter_value<-c(Arg[3])population_structure<-c(Arg[4]) #RIL or F2depth_analysis<-c(1:300)###########input##...

问题 XP-CLR

我用命令参数cd  $workdir/05.select_sweep mkdir xpclr cd xpclr gzvcf=$workdir/00.filter/clean.vcf.gz window=10000 step=5000 做xpclr的时候,做出的值都没有,会出的图是空的,如图(我用的是山羊芯片数据大概有50000snp,参数设置是不是不对?)