conet第一步生成网络图后，执行计算p值所需的置换时，报错 java.lang.NullPointerException
我用的biom文件， conet第一步生成网络图后，执行计算p值所需的置换时，报错 java.lang.NullPointerException
由于我的样本量只有五个，带入conet算一直报错，请问可以怎么处理这种情况呢？需要再多加两个样本，新加样本中的值等于（前面5个样本和/5）吗？这样可以吗？想采取平均值法多弄两个样本出来，请问这样可以吗？会对结果...
最近，有老师反应转录组分析结果中，有两个GO分析文件中同一GO term的基因数量不一样，如下图黄色部分所示： 这里来解释一下，第一个表是做差异表达基因GO分类时用到的统计结果，每个GO term 的基因数量都包含其子节点...
我们通过全基因组重测序对2个亲本和多个子代进行了测序，想通过该数据构建遗传图谱，但是看文章发现要先对亲本中缺失和杂合的SNP过滤，这个是如何过滤的？能不能和子代数据一起过滤？
老师您好，我做的基因家族其中一个亚组没有其他亚族的共有的保守结构域，只有一个跨域越四个外显子编码的200个aa的保守区。这个在后续进行基因结构分析，染色体位置信息及其他分析时要怎么做呀？谢谢 追问一下，不好...
现在已经探究了玉米的一个基因的功能，与玉米的一个数量性状有关，现在有玉米NAM群体的26个亲本及其自交系的材料，可以测定其基因序列和对应的数量性状，如何分析是基因中的哪些SNP导致了性状的差异。要挖掘该基因的优...
老师们好，用几个GSE数据集的DEGs（约300个）做wgcna找hub gene, 结果出来只有两种module（蓝青），，感觉结果有点奇怪……这种正常吗？是因为基因数量太少了吗
这行代码运行后我只得到了3个文件（和demo文件里面不同）如下： 想知道是为什么？
这是参考文章 第一个图是参考多基因组做的 为什么4个不同物种不会分开 3个的可以，请问老师参考文章的图怎么做？
...来自两个相关个体（例如，来自两种不同表型），A / A和B / B以及杂合子A / B的特定DNA序列。 来自A / A和B / B的PCR扩增片段分别含有两个和三个RE识别位点。而 在杂合子A / B中，将获得两种不同的PCR产物，一种被切割三次，另一种...
[root@dd38db80c194 21:48:53 /work/my_rnaseq/R]# Rscript WGCNA.R.R 运行WGCNA脚本，报错，公司的独享服务器，29484个基因
ggplot2 的geom()函数（几何对象）中常涉及图形元素的位置调整position，通过不同的参数调整可以使图片呈现不同的效果，主要的位置调整涉及如下方式： position 描述 dodge 避免重叠，并排放置 fill 堆叠图形元素并将高度标准...