5 做生信的笔记本什么配置够啊?

最近想买个笔记本电脑,顺道做些简单的生信分析,不知道买什么配置够呢?

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omics007

很多同学会有这个疑问:做生物信息分析对笔记本电脑要求高吗?我的笔记本够用吗?

贵的笔记本性能就一定强吗?

小编发现目前网上这方面的信息很少,甚至还有些生信大V做错误的高中低配笔记本推荐,小编点进去一看“中配”的性能反而远低于廉价的“低配”,相信他也和很多人一样认为贵的,性能就好。但事实并不是这样。

本文将介绍笔记本中的哪些部件会影响生物数据的处理速度,选购笔记本时应当注意的问题,有需要的同学赶紧收藏本文吧!

两点说明:

1. 本文仅适用想买自用笔记本顺便兼顾下生信分析的同学,如有海量数据分析需求的同学还是乖乖的买专业服务器吧;

2. 本文主要是给硬件小白科普之用,力求讲解通俗,不会精确描述技术细节。

做生信的笔记本需要考虑什么因素?

正常来说选购笔记本要考虑性能、屏幕素质、便携性、续航、扩展性、做工等等方面,但本文既然是讲解是否适合做生信分析,那就只讲解“性能”这一个方面,毕竟只有性能才决定了数据分析的速度,甚至能不能做某些分析。

其他因素也会在很大程度上影响笔记本的价格,比如选配一块广色域4k分辨率的触控显示屏价格就要贵上几千块;同样的性能,轻薄的超极本价格也会大大高于普通笔记本,这也是为什么说价格高,性能并不一定高。

性能和什么部件有关?

笔记本有很多的部件,CPU、主板、内存、硬盘、显卡(GPU)、电池、键盘等等,但从是否适合做生信来看,只需要考虑两个半部件就行了。

第一个,也是最重要的:CPU

CPU,即中央处理器,是笔记本的运算核心和控制核心,直接决定了生物数据分析的速度,越强的CPU执行同一个任务需要的时间就越短。CPU没啥具体推荐标准了(但最好也别低于i5了),预算范围内越高越好,低了通常也能分析,就是慢。

英特尔的CPU一般通过名字就能预估强弱了,具体参考下图:

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CPU的性能和很多指标有关,我们学生信的也没必要一一研究,在此我们直接贴一张CPU性能天梯图(来自百度笔记本吧),在这个图里越靠上的性能越强,大家可以保存查询。

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第二个要考虑的部件:内存

内存,即运行内存RAM。系统运行时CPU需要读取硬盘上存储的数据,但是CPU的运算速度远远高于硬盘的读取速度,直接交换数据的话,效率很低。而内存的读取速度远高于硬盘,因此需要使用的数据会暂时储存在内存里拱调取,这样效率就高了很多,这也是为什么有的软件开机之后第一次打开会很慢,而第二次再开就快多了,因为数据已经缓存在内存里了。

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在很多情况下,生物数据量都很大,因此运算时占用的内存也很大,内存不足的话,可能会导致数据运算的同时,无法进行其他工作(比如看个电影、浏览网页),甚至完全无法运算。我们建议8GB内存起步,最好能加到16GB或以上,其他诸如内存频率等参数不用太在意,只要是正规品牌的新款笔记本都没问题的。当然如果想做无参转录组组装这种级别的分析,还是买个服务器吧。

最后半个要考虑:硬盘

七八年前,衡量性能确实是不考虑硬盘素质的,容量大就行,但是近几年随着固态硬盘(SSD)的普及,这就值得一说了。

通常感觉电脑慢,往往一块老旧的机械硬盘就是罪魁祸首。固态硬盘相对于传统的机械硬盘,其读取小文件的速度(4k随机读取能力)有了巨大的飞跃,而我们日常的操作中最频繁的就是各种小文件的读取,一块固态硬盘可以大大提升电脑的流畅度

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固态硬盘虽然不能直接提升笔记本的运算速度,但是在日常操作中可以让你感到丝般顺滑,所以强烈推荐选购带固态硬盘的笔记本,不过固态硬盘目前价格还是比较昂贵,可以选择固态硬盘加机械硬盘的组合配置。

独立显卡是否需要?

另外值得一说的是独立显卡,显卡(GPU)的主要功能是控制电脑图像的输出。家用笔记本的显卡主要是两大作用,玩大型游戏和专业图像处理(建模渲染等),如果你对这两方面都没有太大的需求,建议选配不带独立显卡的笔记本,生信分析一般对GPU要求不高。通常CPU就自带了核芯显卡,完全可以满足日常的视频播放、网页浏览等需要。高端独立显卡的价格很高,甚至会是笔记本里最贵的部件,放着不用的话既浪费钱又徒增发热量。 

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好了,和生物信息运算相关的因素就说完了,在预算有限的情况下,建议优先考虑性能,在此基础上再考虑做工、屏幕等因素,毕竟只要是正规品牌的笔记本质量还是有保障的。

希望本文能够对那些自费购买笔记本同时又想兼顾生信分析的同学有所帮助,土豪请直接购买MacBook Pro、ThinkPad x1顶配,有游戏需求的土豪购买Alienware、ROG、MSI顶配即可。

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  • 提出于 2019-05-08 21:40