问题 重测问题

...base_limit 10 \    -i $datadir/${i}_1.fastq.gz \    -I $datadir/${i}_2.fastq.gz \    -o ${i}_1.clean.fastq.gz \    -O ${i}_2.clean.fastq.gz \    --detect_adapter_for_pe \    -h ${i}.html -j ${i}.json"fastp --thread 50 --qualified_quality_phred 10 \    --unqualified_percent_limit...

文章 WGCNA分析要求

... 1. 需要多少个样本？     1.1 至少需要15个样本，推荐20个以上的样本。     1.2 样本越少，网络的噪音就越大，样本越多，网络就更加的稳健。 2. 基因是否需要进行筛选？     2.1  一般对表达量低，在样本间变化不大...

文章 SURVIVOR合并单样品SV出错

...hare/work/biosoft/SURVIVOR/SURVIVOR/Debug/SURVIVOR merge sample_files 1000 2 1 1 0 30 all_sample_sv.vcf 但如果遇到只有一个样品时会生成空的vcf。这时候可以改成如下命令运行： ls *.max.vcf >sample_files && /share/work/biosoft/SURVIVOR/SURVIVOR/Debug/SURVIVOR ...

文章 简单科普：2019诺贝尔生理学或医学奖为啥颁给“细胞感受氧气”？

...廉·凯林的一句话结尾： “The most dangerous result in science is the one you were hoping for, because you declare victory and get lazy.” ——科学中最危险的结果就是你所希望的结果，因为你会宣布胜利并变得懒惰。 大佬们永远不会止步于当前的...

问题 下载你们的GWAS镜像后，在运行时总卡住，等待一段时间后就报错了，是因为这个镜像没有下载好或者安装正确吗，docker images也可以看到v1.2的版本

问题 要进行单倍型分析，但是镜像不是搭建在2.0版本了，docker pull下载不了，联系客服拿到安装包之后一直报错，解决了一天了也没解决问题，求解求帮助

问题 文献分析，只有BigWig文件能否完整做出下面的图像

在文献中《Global profiling of RNA-binding protein target sites by LACE-seq》没有发现他们的LACE-seq数据，只找到了他们处理后的BigWig文件，使用数据GSM4094532_MVH_1oocyte_rep1.bigwig进行后续作图时，用ChIPseeker包进行注释后发现与文献中的结果差别...

问题 建立共享文件夹失败错误提示wrong fs type, bad option, bad superblock on bioshare

mount: wrong fs type, bad option, bad superblock on bioshare,       missing codepage or helper program, or other error       (for several filesystems (e.g. nfs, cifs) you might       need a /sbin/mount.<type> helper program)       In some cases useful info is found in s...

问题 您好，我在检索完一个2.3G大小的基因组文件后，得到.misa 和.statistics为后缀两个文件，在用调用primer 3.0批量设计引物时，这块看不懂，您能叫我一下吗

文章 如何鉴定测序文库是不是链特异性

... 如果是普通的转录组测序文库，那么就会存在Read1, Read2 以相等的概率来之基因的正反链。这就导致Read1, Read2 上的GC分布倾向于等比例。而如果是链特异性的，那么Read1， Read2 会存在一定比例的GC偏离。 但是这也不是绝对的，有...

问题 VCF文件按照指定的染色体排序

...vcf \    SD=sequence_dictitionary.dict）。运行后，出现了Unable to access jarfile picard.jar。麻烦看看怎样解决。

问题 计算KaKs

...，如下图，不知道哪里操作错了，注：已经将KaKs_Calculator2.0文件从课程视频中下载并存放到share3目录下，并解压。 manager@bl8vbox[gene_deplication] /home/manager/share3/KaKs_Calculator2.0/KaKs_Calculator2.0/bin/Linux/KaKs_Calculator -i id1.axt. -o id1_kaks.txt ...

问题 老师您好，我在用MEGA11建系统发育树时出现了错误的提示

MEGA failed to parse the input file:Invalid base found:1(in line 4）

问题 WGCNA分析中，β值未达到0.8，计算机给出的β估计值为1，我觉得不是很合理，想取β值=0.7对应的n值（如图2所示，n=21），这样可行么？

问题 LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region scaffoldC01:46993000-46994000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt这条代码如何修改能使中间的字体大一点