请问老师,公司给返回的SNP 结果里SNP 和indel是2个文件,merge.SNP.gz, merge.indel.gz,处理merged.SNP.gz的时候还需要运行过滤indel附近的snp这一步吗?我试了一下merge.SNP.gz过滤前39G, 过滤完了还剩22G了,不知道这个结果对不对
请问这个图是用的什么数据做的啊,R语言的哪个包,谢谢哦
... org.Xl.eg.db 注:全基因组注释,由EntreZ对应多个数据ID和信息 org.Hs.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Human3org.Mm.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Mouse5org.Rn.eg.dbBioconductor Package Maintai...
TC开头的序列在NCBI上查不到,请问各位老师这些序列在哪些数据库能查到?比如,TC270835,TC261826.
...号做分析相,想做门水平的细菌,第二个表是抗性基因的数据,想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错
...,是一种常见的癌症亚型分类研究方法,可根据不同组学数据集将样本区分成几个亚型,从而发现新的疾病亚型或者对不同亚型进行比较分析。这类文章一般会对基因表达量(芯片数据或者RNA-seq数据)或甲基化等数据进行聚类...
...就简单介绍一下pheatmap绘制热图。 1. 基因表达聚类热图 数据准备 pheatmap绘制基因表达数据热图,需要一个基因表达数值矩阵文件,数据格式往往是行为基因表达数据、列为样本信息(如下图20*6): 确保安装和加载包之后,...
已经分清单通道和双通道数据的区别。且根据定义,红荧光代表处理组,绿荧光代表对照组,且M值=log2(R/G),能够看出该基因在该样本的上下调情况,即负值代表下调,正值代表上调。而似乎做差异表达分析的数据不该出现负...
...hway富集结果常用气泡图来显示,其基本代码如下: 案例数据: > dat ko_id Kegg_pathway Rich_factor Pvalue DEGs1 ko00195 Pho...
如图,就是这种情况!