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文章 GWAS模型介绍

...群体节省时间。 GWAS分析模型介绍 GWAS 分析一般会构建回归模型检验标记与表型之间是否存在关联。GWAS中的零假设(H0 null hypothesis)是标记的回归系数为零, 标记对表型没有影响。备择假设(H1,也叫对立假设,Alternative Hypothesis)...

文章 如何预测同一基因不同转录本对应蛋白的功能域差异

...常好用的数据库—Uniprot蛋白数据库。 以目植物中前研究比较热的明星基因“FLC”为例,为大家演示操作过程。 首先在Uniprot网站(https://www.uniprot.org/)检索框输入基因名称,点击检索后如下,数据库会在页面左侧展示存在该基...

文章 Excel图表保存成高清图片

...必说保存成高清大图方便科研论文投稿。今天就来教大家如何将Excel图表导出成高清大图方便后续编辑。 此处,编建议大家先行了解SCI文章图片相关要求,可参考:投稿时-文章中图片大分辨率如何设置(免费领两大图片编...

文章 envfit()的线性拟合:非约束排序(PCA、CA、PCoA、NMDS)

...主要物种)在各样方中的丰度分布规律。然后再通过多元回归的方式将环境变量被动地添加到非约束轴中,观察各样方所处的环境梯度,并使用环境变量对群落组成及物种分布作出解释。   envfit()的线性拟合 首先将物种多度...

问题 KAKS作图问题

1.请问如何调整kaks_plot.r包中参数才能使左边geneID上下不那么拥挤? 2. 如何去掉下图中完全空白的部分重新作图?

文章 R语言-相关性矩阵分析

R内置函数 cor() 可以用来计算相关系数:cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman")),可计算pearson、kendall、spearman三种相关系数。 cor函数计算的是列与列间的相关系数,得到的举证C(i,j)是第i列与第j列相关系数。  例如如下数据:...

文章 一个好的“产品经理”该如何诞生?

...做好基本功,才能成功。  ![一个好的“产品经理”该如何诞生?](https://img-blog.csdnimg.cn/20200325141104264.png?x-oss-process=image/watermark,type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk,shadow_10,text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzQxMTM3NDkz,size_16,color_FFFFFF,t_70) 那么我们...

文章 R语言中的回归分析公式中各种符号的含义

R表达式中常用的符号 推荐学习R语言获得更多生物信息分析技能:R语言画图、R语言快速入门与提高 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分...

文章 ggplot从数据到图形绘制逻辑

...换(stats):对数据进行的某种汇总,如分组计数、线性回归等。可选,但很有用。 标度(scale):将数据的取值映射到图形空间,如用颜色、大或形状来表示不同的取值,使读者可以从图形中读取原始数据。展现方式为绘制...

文章 KEGG富集分析弦图绘制

在阅读文献过程中经常可以看到一些比较复杂的弦图,比如说《A simplified herbal formula for the treatment of heart failure: Efficacy, bioactive ingredients, and mechanisms》这篇论文中的弦图(下图所示),首先该图总体想要传递的信息为不同基因...

问题 老师您好,差异甲基化分析中使用CHAMP包时,是如何确定case组和control组啊

group_list=myLoad$pd$Group myDMP <- champ.DMP(beta = myNorm,pheno=group_list) 这里是怎么确定case组和control组啊,我自己对差异后的探针求和,发现好像反了,也不知道如何调整

文章 企业团队敏捷产品开发流程的最佳实践

...长度根据冲刺的长度而定,占用整个冲刺的5%左右时间是比较合理的,比如两周的冲刺应该控制在4时以内,一个月的冲刺应该控制在8时以内。 冲刺规划过程应该由整个团队协作完成,产品负责人从现有的产品列表清单中...

文章 R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程

首先模拟一份数据集df<-data.frame(x = c(1:100))df$y<- 2 + 3 * df$x + rnorm(100, sd = 40)head(df)ggplot2基本的散点图并添加拟合曲线library(ggplot2)p<- ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_smooth(method= "lm", se=FALSE,  color="black", formula = y ~ x...

文章 投稿时-SCI期刊文章中图片大如何设置

1.理解 像素,DPI,打印尺寸之间的关系: 图像分辨率,像素数和打印尺寸在数学上关系: 像素=分辨率(DPI)×打印尺寸(以英寸为单位); 其中,DPI为每平方英寸像素数目,也就是图像细节程度的度量。理解了上述概念我们...

文章 基于WSL2的docker更改存储位置

...。 Docker下载完毕默认存储位置是C盘,很多伙伴的C盘比较满,因此需要或更改Docker的存储位。   一、查询当前docker的状态,退出Docker Desktop 1.首先,我们以管理员的身份打开power shell或者cmd(管理员身份的权限更高),这里...