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文章 生存分析的一些基本概念

...下。 生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断,研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法,也称生存率分析或存活率分析。起始事件(initial event):反应...

问题 请问老师,泛基因家族鉴定开始做自己的物种时,怎么在docker 里上传自己需要做的物种的数据

用这个指令进入docker work里面 data一直是教学时玉米的数据 曾经尝试过在FZ里pangene里的data上传自己的数据

问题 TCGA数据中如何区分样本是癌症还是癌旁?

问题 如何利用自己的差异基因数据绘制kegg注释图

问题 测序的数据txt格式如何转换成fasta格式

问题 gemma分析时,有的样本表型数据缺失怎么办?

问题 在ncbi找不到制作热图的数据,怎么办

问题 iGRN数据库如何找到上下游调控基因

问题 iGRN数据库如何找到上下游调控基因

文章 在R里绘制地图

在R语言中绘制地图是数据可视化的一个重要方面,其提供了多种方法和工具包来绘制地图,包括基于经纬度数据的地图、行政区划图等。今天教大家使用ggmap、maps这两个包,进行地图的绘制。 ggmap 1 代码 ggmap包能够从多种在...

文章 Split划分数据

利用split可以对数据进行分组 split(x, f, drop = FALSE, ...) x 表示一个待分组的向量或者数据框 f 表示一个factor或者list,以此为规则将x分组 drop 是逻辑值,如果f中的某一个level没有用上则被弃用 例如有如下数据: dat Samples g...

问题 NCBI中下载SRA数据不成功

...学大讲堂里面的几篇贴子,用了2种方法都没有成功下载数据 第一种,按照操作方法获得了SRR List文件: 按照规律生成ftp下载地址: 粘到迅雷中发现都是空的。   第二种方法是获得了SraRunInfo.csv文件,如下: 在biolinux中...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌(NSCLC)(GSE127465)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肿瘤浸润性髓系细胞 (TIM) 包括单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞和中性粒细胞,已成为癌症生长的关键调节因子。这些细胞可以分化成一系列状态,这些状态可能会促进或限制肿瘤生长,但目前...

文章 TCGA生存分析课程的数据准备

请问,在TCGA差异分析课程中的差异表达矩阵是用ensembleID表示lncrna,而TCGA生存分析的表达矩阵是用lncrna的gene symbol,请问是怎么转换的,用ensemble官网转换之后,代码总报错,请问该怎么解决呢,谢谢

文章 投稿时-SCI期刊文章中图片大小如何设置

...的尺寸是不是30mm:354/300*2.54*10=29.97mm,  最后相乘的两个数据是把英寸换算成毫米,正好是30mm。所以知道了上述关系我们就可以利用Photoshop来编辑我们的图片了; 下图为图示大小: 3.Photoshop调整图片: 例如我这里有一张图...