问题 老师你好，麻烦请教一下用dCAPS Finfer2.0网页，如何设计dCAPS标记，有引入1个错配还有2个错配的，不知道选哪个合适。

问题 我想问一下从公司获得测序数据如果是以下的cleandata，我们是否从章节2课时6看起就可以了呢，是否向需要进一步质控？

问题 win10专业版是已激活的正版（见图1）却没有hyper-v选项（见图2），使用代码（见如下文本）进行重新安装也显示找不到文件（见图3）

...ages\*Hyper-V*.mum >hyper-v.txtfor /f %%i in ('findstr /i . hyper-v.txt 2^>nul') do dism /online /norestart /add-package:"%SystemRoot%\servicing\Packages\%%i"del hyper-v.txtDism /online /enable-feature /featurename:Microsoft-Hyper-V-All /LimitAccess /ALL

问题 微生物16S分析物种功能预测PICRUSt2部分，进行代谢通路差异比较可视化

微生物16S分析物种功能预测PICRUSt2部分，进行代谢通路差异比较可视化时，如果是三组之间比较分析，这个代码应该怎么修改，谢谢老师！Rscript $scriptdir/ggpicrust2.r --daa_method $m  \     --pathway_table q2-picrust2_output/pathway_abundance.qza \ ...

问题 转录组与转录组之间所有序列进行两两比对

老师您好！ 我的问题是我现在有两个转录组序列1跟2，我想做的是将转录组1中的所有序列跟转录组2所有序列中进行两两比对(不是blast，需要全局比对)，最后只需要转录组1中所有序列与转录组2对比序列相似性最优结果，比如1...

文章 Win11怎么关闭Hyper-V?关闭Hyper-V的2种方法

Windows系统中内置了Hyper-V虚拟机，用户通过开启Hyper-V可以实现在一台计算机上同时运行多个操作系统。在win11系统中，Hyper-V是默认启用的，但是在用virthual box时，有时候就需要关闭hyper-v。很多用户不知道如何操作，接下来马上...

文章 Pacbio三代无参全长转录组(Iso-Seq) 的转录本合并策略

...比较经典的一款软件，在转录组分析中经常用到     1.2     结果容易理解： 该软件就只是简单的基于序列的相似性，进行转录本的合并，转录本的ID都不会变动。 2. 缺点：     2.1    无法区分那些转录本来自同一个基因...

问题 picard.jar安装，已从网站上下载picard.jar 2.6.0运行jar -O picard.jar显示 Illegal option: O需要怎样改正

改为0后需要添加怎样的参数

问题 质控数据

...图1中红方框中的碱基序列长度修改是否可以根据文件“2.fastqc”中的“multiqc_report.html”中图2的bp平均值进行相应修改，如果可以，那么修改原则是什么，是数据集中的波峰前取值还是波峰中间取值，比如图2波峰是300bp，那么我...

问题 基因家族课堂中circos美化图片课程中，有一个colline_v2.pl，请问下这个脚本在哪？我从第一节课看到后面都没找到。

问题 老师好 我在用qiime2进行机器学习时，报错Error: QIIME 2 has no plugin/command named 'rescript'，我应该怎么安装这个插件呢？

文章 MNP标记设计

...于标记的多态性、标记的数量和基因分型的准确性。 2. MNP标记设计方法 使用重测序生成 SNP设计MNP标记。使用125个碱基对（bp）的滑动窗口 以5bp 的步长扫描基因组。多态性窗口的筛选标准为DP指标： DP= t / c ( N ,2)，其中c ( N ,2...

问题 急求gene pattern的submap教学

...谢谢！ 图来自文献Metabolism-associated molecular classification of hepatocellular carcinoma（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7138397/#mol212639-sup-0002）FigS3.

问题 请问perl正则表达式的捕获中为什么老师只讲了捕获一个变量$1,如果要捕获$2 $3 $4要怎么做？我这样做为什么不行？

文章 主成分分析（PCA）如何计算方差解释率

...坐标的百分比。 （文章链接：https://doi.org/10.1038/s41467-021-23879-2） 方差解释率计算方式（以R为例） 1.方差已知 若通过plink，GCTA等软件计算pca值，会获得eigenvec和eigenval两个文件，前者记录特征向量，用于绘图；后者记录特...