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问题 老师，请教您一个关于RNAseq数据分析的问题，如果我有1个对照组、3-5个实验组（每个实验组有两个重复），我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗？可以用什么方法呢？ 我目前只接触过两组间（1个对照组、1个实验组）基因表达数据的差异分析，未接触过多个实验组数据的分析，所以想请教下老师，希望得到您的帮助，先谢谢您啦！

请问多个处理组分别和对照组比对，比如处理组1和对照组比对，在命令中是怎么输入啊？老师，教程上是一个处理组一个对照组，-r指定对照组就行，但是如果还要指定对照组，怎么输入呢?谢谢！

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问题 用TCGAbiolinks下载数据时无法选择primary site的分类

老师我在下载TCGA数据时想下载特定部位（primary site）的病例数据，所以加了primary_site <- "Gum"和primary.site = primary_site,但是运行后显示错误 ，我应该怎么改？

问题 问一下老师 做基因家族分析 用新生成的hmm文件做hmmsearch 报 TC bit thresholds unavailable的错

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问题 安捷伦Agilent双通道文件，如何做差异分析？是否直接用红荧光的数据就可以跟单通道文件一样处理吗

...件的处理，得到了红绿荧光的表达量，那么是否可以直接用红荧光的数据来做差异表达及其他分析呢？还是用M值做呢

问题 在mapman里，我要导入数据，但我的DEG文件，但有些数值是Inf 有些是-Inf,要用什么代替呢？

老师： 您好！在mapman里，我要导入数据，但我的DEG文件，但有些数值是Inf  有些是-Inf,要用什么代替呢？望指教

问题 用W11安装docker后，docker search omicsclass出错

用W11安装docker后，docker search omicsclass出错 Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connection because  has no HTTPS proxy: connecting to index.docker.io:443: dial tcp 108.160.172.1:443: ...

问题 gsds绘图顺式作用元件用bed格式，为什么提交提示第一行文件错误

谢谢 感激不尽 卡这里好久了