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文章 ggplot2点图geom_point中点的shape有多少?

ggplot2可以利用geom_point绘制散点图,而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢?(注意此处只介绍shape的设定,不是aes(shape)映射) 可以通过查询?shape 获得以下内容: # Shape examples # Shape takes four types of values: an integer in [0, 25], #...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程,配制分析环境(doc.sh)遇到Bug

...io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一镜像,可以启动docker pull进行镜像下载,但是4小时后仍然报错“Error: writing blob: storing blob to file "/var/tmp/storage1966479595/2": happened during read: unexpected EOF[us078@omicsclass  01:28...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程,配制分析环境(doc.sh)遇到Bug

...micsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一镜像,可以启动docker pull进行镜像下载,但是4小时后仍然报错“Error: writing blob: storing blob to file "/var/tmp/storage1966479595/2": happened during read: unexpected EOF[us078@omicsclass  01:...

文章 cBioPortal数据库使用教程

...向新的生物学视野,治疗和临床特征的转变。 cBioPortal这网站,促进多维度癌症基因集数据的探索,可以允许跨基因,样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一癌症研究中多样本间基因改变的模式,并比较点多癌症...

文章 2019年国自然结果分析,生命科学领域难度又又又增加了吗?

...么增长了这么多,你还是没中呢? 怪只怪大家研究都做得更好了,参与度更高了, 这一点从往年递交份数的显著提升和中标率的总体下降就能感受到(青年项目从17.03 % 降至 15.19 %,面上项目从 19.40 % 降至 17.68 %)。 另外,年龄因...

问题 关于差异基因表达的问题

我的数据是种子在授粉后四不同天数的转录组数据,经过分析得到了count值和fpkm值,请问我可不可以把其中一组数据作为对照,然后用其他三组数据去做差异表达分析

文章 STAMP使用(组间差异)

...它不基于数据是正态分布的前提。此方法要求每组至少5样本。t检验假设两组有相同的方差,当假设成立时,它比Welch’s检验更强,主要用于样本含量较小(例如n<30),总体标准差σ未知的正态分布。Welch’s t-testt-test的一种...

文章 NCBI下载SRR并转换为fastq文件

...击BioSample对应的数字,跳转到以下界面: 任意点击一样本,得到该样本的信息,之后点击下方SRA,点击 study 中的 all runs 进入到全部样本界面,此处若是想下载该样本,可点击蓝色圆圈(见后续补充) 二、下载SRR文...

文章 百万样品GWAS解释精神疾病间的遗传关系

...出这些病症之间的生物学联系是十分困难的。首先人脑是很复杂的器官,我们很难对其进行精细扫描,活体解剖也不符合伦理。同时很多精神疾病会并发,当不同疾病之间相互影响的时候,我们很难去分析它们的根源。 2018年...

文章 ifconfig不显示ip

...                      TYPE      DEVICE  eno1  1377a295-708b-4cb4-a1cb-04d8d58cc2bc  ethernet  eno1    lo    e9513de2-7f3b-4faa-a7c0-c8544e0bdcfa  loopback  lo      eno2  fe51385f-86b2-470d-a846-27c73ac4eff1  ethernet  --      eno3  f9129c6b-ca95-4d81-b165-13254c...

问题 泛基因家族分析-数据准备

我们的研究物种,目前没有泛基因组,我想自己组一进行接下来的泛基因组基因家族分析,但是目前的疑问是?需要下载10同属染色体水平基因组,但是,需要重新组装注释么?还是说只要重新注释?

文章 细胞凋亡检测最火方法——Annexin V/PI双染法

...证优异的实验结果; 6、专业的售前售后技术支持,可以更好完成凋亡实验。 Annexin V系列凋亡检测产品目录 Ø Annexin V荧光双染凋亡试剂盒 Ø Annexin V凋亡检测单品 Ø Annexin V蛋白 实验数据:Annexin V-FITC/PI检测试剂盒分群效...

文章 小麦MADS-box基因家族文章 new phytologist(7分)

小编一直在强调,基因家族分析是一研究思路,同时也可以成一篇文章!不过大部分基因家族套路式文章影响因子在2-3分左右,3分以上需要添加实验等内容;不过,现在有一篇小麦MADS-box家族文章却发表在new phytologist(7分)...

文章 proteusTMT 分析蛋白质组数据时,meta文件的格式是怎么样的?

...设置样本标记信息和分组信息。 meta文件,格式(采用tab 分割)如下: measure experiment sample    condition replicate Reporter intensity 0 1 A-1 A 1 Reporter intensity 0 2     A-2     A     2 Reporter intensity 0 3     A-3     A    ...

文章 毕业答辩现场,导师扔了自己的论文怎么办?

想象一下: 你紧张了好久月,“努力准备”了好几月,就为了答辩这一天, 然而没想到,导师直接把论文扔了; 同样,导师也很“莫名其妙”,甚至有点愤怒: 当了大半辈子教师,答辩了这么多学生,临了居然靠扔论文...