问题 python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 0 values to unpack

问题 GEO里面同一个文章名字，同一个作者，GPL一致，GSE不一样，发表年份一年，那么如果要进行数据分析的话，这个都需要拿出来分析么？还是只分析样本数据最多的哪个

文章 TCGA和GEO套路文章解说

...究，而又想发SCI文章，此时我们最经济有效的方法就是：分析一下别人的数据，筛选出一些有价值的分子（mRNA，miRNA，lncRNA，circRNA，lncRNA），之后在自己的小样本中验证一下，发篇SCI文章还是轻轻松松的。接下来我们来介绍一...

文章 绘制生存曲线图

在单因素生存分析完成之后，可以绘制一个单因素的生存曲线图。 # 表达信息和生存数据整合到 exprSet, 其格式如下： bcr_patient_barcode time status LINC01587 XXbac_B461K10.4 1 TCGA-2W-A8YY 148 0 3.981761 23.89057 2 TCGA-4J-AA1J ...

文章 GWAS中P值的筛选阈值原理是什么

GWAS关联分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq 对于统计学假设检验来说，多重检验校正是一个非常重要的领域。我们在进行假设检验的时候，通常会设置一个零假设，之后计算出一个p值，即数据分布符合原假设的概率，p...

问题 基因家族分析 处理GFF 文件里面ID不对应，该怎么处理

按照课程，我查看了一下蛋白质fa文件和GFF3文件，发现了如图中的问题，例如蛋白质fa序列ID是evm.model.supercontig_0.109，对应gff3文件中ID=PAC:16403813;Name=evm.model.supercontig_0.109。有哪位老师知道这个问题该怎么处理？

文章 利用NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息

相近功能基因的检索方法 在做数据分析的时候很多老师经常需要搜索某一类功能的基因，有两种思路可以实现这一目标。第一种是直接序列比对，认为序列相似即具有相似的功能；第二种是利用这一类基因共有的蛋白保守结...

问题 想请教各位老师在串联重复分析时有碰到类似的情况吗？初次接触不知道该如何调整是好。

问题 老师，您好，我在做共线性分析的时候#blastall 比对，所有基因对所有基因提取不出文件

问题 ANNOVAR变异注释报错：Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

... feature gene， 当时按照提示解决的：-ignoreGroupsWithoutExons 不知道是不是这里的问题影响了后边？ 这个问题我在Github上查了一下，有个人提问作者，和我的问题是一样的 作者给出的回答是手动改掉有问题的那三行，给后边加...

问题 想问一下，边界分析做出的图，和它描述的序列特征表中的各个区的长度不一致的话，是正常的吗？会不会有什么影响呢 叶绿体分析

文章 docker配置国内源加速下载，linux版本

0、镜像源参考 中国区官方镜像：https://registry.docker-cn.com 中科大源：https://docker.mirrors.ustc.edu.cn 阿里源：https://cr.console.aliyun.com 腾讯源：https://mirror.ccs.tencentyun.com 网易源：http://hub-mirror.c.163.com ...... 注：除了中科大源，其他未...

文章 perl数学函数

...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...

问题 在做WGCNA分析时，生成的模块数量过多，且模块之间的相似性不高，如何减少模块的数量？

问题 请教：基因与mRNA的对应关系分析不正确

我的物种序列只有NCBI上有公布，在做mRNA和gene的ID对应关系输出的时候出现问题，请问怎么解决？   下面是gff文件的信息： rna文件信息如下，ID是以XM_开头。 protein文件信息如下，ID是以XP_开头。 对gff文件进行处...