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文章 如何让生信大咖解决自己的问题

...最终问题也就得不到解决。下面我们就来聊聊如何提出一个“好”问题。 错误的提问方法： 懒惰型：代表性语句是"在吗"、"有没有人熟悉XX软件"、"有没有人做过XX分析"。这让潜在回答者不敢应答，谁知道回答这个没边界的问...

问题 请问虚拟机进不去咋办

好久没用了，今天想做个热图，小鲸鱼也打开了，输入进入虚拟机命令，发现进不去

问题 重测序

nohup ParaFly -c  sh w.sh -CPU 2 > w.sh.o& 这个命令对吗？ 是用大于号把？ nohup ParaFly -c  sh w.sh -CPU 50 > w.sh.o&amp （独享服务器有56线程，我用到50个线程可以把-CPU 50？）

问题 差异基因用p-vaule筛选可以吗？

老师，您好：转录组分析时因为DEGs个数较少，用的p-vaule筛选的DEGs,审稿人一直问为什么不用FDR，老师这个问题该怎么回答。 Point 6: - Line 600: DEGs were determined using p-value < 0.05 and fold change ≥ 1.5. What is the rationale behind using pvalues i...

文章 空间转录组数据预处理

...有单细胞分辨率的,一般是将一团细胞所处的位置定为一个spots,通过不同spots 的差异体现出空间的差异 10x visium数据预处理 ST包含多种方法,分别是ISH原位杂交,ISS原位测序,以及ISC原位捕获,前两者其实精度已经达到了亚细胞级别,...

文章 linux大文件分割 分开行数小文件 split命令

...文件。　　语　　法：split [--help][--version][-<行数&gt;][-b <字节&gt;][-C <字节&gt;][-l <行数&gt;][要切割的文件][输出文件名]　　补充说明：split可将文件切成较小的文件，预设每1000行会切成一个小文件。　　参　　数：　　-&...

问题 MEME就运行脚本的时候，其中的maxsize 指最大输入文件的字符数，maximum dataset size in characters，这个是指多少b吗，6000000是指文件最大6M，单位是什么？时间的最大值单位是秒吧？，motif的个数最小长度一般是多少？有什么参考的吗，最大长度是多少，这个长度的单位是什么，多少b，还是多少kb？

/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme ../WRKY_pep_confirmed.fa -protein -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100

问题 circos图的名字显示问题

想在这个图片中的，多个名字来自于一大个点，距离较近，怎么配置啊，我的总是不显示完全，会有遮挡的 谢谢啊，没有金币了

问题 关于interproscan的问题

老师，您好！运行interproscan.sh时，用您教的方法（ -appl）试了一下，运行了1天后又没有新文件更新了，后台还在运行，大概3.8万个基因，这种情况正常吗，我是否需要再等等，或者有别的解决办法？谢谢老师！

问题 群体遗传PSMC问题

群体遗传课程57课PSMC那里，我看视频是一个.bam文件就能做一次分析，出一张图了。那我的数据有200多个样本400个bam文件怎么办呢？？需要合并吗？怎么合并啊？ 下面这个是例子代码：

文章 seurat_sc_cluster.r 使用帮助：

$Rscript scripts/seurat_sc_cluster.r -husage: scripts/seurat_sc_cluster.r [-h] -i filepath [-d dim]                                   [--resolution resolution [resolution ...]]                                   [--umap.method umap.method]                 ...

问题 转录组测序数据量如何选择？

我想做个转录组实验，但是不知道应该测多少合适，公司说有有4G、6G、8G之类的是啥意思？怎么衡量测的数据量够不够呢？

文章 项目经理该如何面对频繁的需求变更?

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问题 做完蛋白组后，验证如何做呢？

挑选几个蛋白进行验证呢？挑选的标准是什么呢？都有什么方法呢？

问题 hgmd,omim,lovd数据库

老师 能分享一下最新的这几个数据库的下载数据吗，多谢多谢