...害后0, 2, 4, 12和 24 h后玉米叶片进行转录组测序分析，对5个时间点样本转录组基因表达水平PCA分析发现0h和2-, 4-, 12- 和 24-h样本明显分离（图a），表明玉米螟为害对玉米叶片基因表达产生了显著影响。 为害后2-h, 4-h,12-h and 24-h...
接上个问题：老师为啥基因组gff文件没有内含子序列呢？另外gene为啥和mRNA一样长啊，不应该gene更长吗？
...章。当然，小编做的统计也不完全，但无论完全与否，两个月的时间150多篇文章，这个数量已经非常可观了。这也强有力的说明了“基因家族分析类文章依然坚挺好发”。 小编也特意挑选了一篇本月刚发表在Genomics（IF：3.16）...
...行了实操，质控等正常，但是转录组数据比对到基因组这个步骤总是出现比对率只有零点几的情况，尝试了好几个转录组数据，从来没正常过。 水稻转录组测序数据显示如下，NCBI下载的单端数据：1 @SRR22419667.1 A00133:246:HNTYVDSXY:1...
我想做圈图，由于在一个位置上有12个基因，直接用标签没办法显示，想问问老师，这个图中的红色标注的折线是怎么实现的呢？
..._vs_tumor.DEG.final.tsv 文件与demo中的基因数量不同，demo中319个基因，而自己练习生成的数据是92个，为了排除bug原因，尝试使用demo中normal_vs_tumor.DEG.final.tsv 进行KEGG富集，发现依然如上报错。使用chatgpt查询代码错误，提示检查输入...
...冻，-80度保存，并提取RNA，用于转录组测序分析。一共4个样品：W+HRW、W、UV-A、UV-A + HRW，两两对比形成差异组合。共鉴定出14564个差异基因。并通过聚类热图、维恩图等来进一步分析了各个差异组合中差异基因的上下调情况。 3...
在Linux系统中，grep（Global Regular Expression Print）是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行，并将其打印出来。今天，我们结合以下示例，深入了解一下grep命令的详细使...
qRT-PCR是一种相对表达定量的方法，他的计算方法有很多，常用的相对定量数据分析方法是KJ Livak（Applied Biosystems）等人在2001年提出的“比较Ct法相对定量”，即：利用ΔCt值差异来推算基因表达差异（Ct目的基因 – Ct内参基因 = Δ...
RagTag是一个集合功能的软件可以用来构建scaffold、提升基因组组装质量，其主要功能用法如下： usage: ragtag.py <command> [options] assembly improvement: correct homology-based misassembly correction scaffold h...
...器间进行数据共享。数据卷呈现给Docker容器的形式就是一个目录，支持多个容器间共享，修改也不会影响镜像。使用Docker的数据卷，类似在系统中使用 mount 挂载一个文件系统。Docker文件系统工作情况想要了解Docker Volume，首先我...