MA图主要应用在基因组数据可视化方面，实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据，现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下： M一般做Y轴，A一般做X轴。 M常对应差异表达...
各位老师，我已经测了转录组，有拼接结果，我想克隆hsp70基因做原核表达，我应该怎么挑选序列，并且怎么判断序列是否完整
通常来说，进行图片绘制的时候如果存在数据分布差异过大的情况，我们更倾向于选择坐标系截断（gg.map等）的方式去展示于结论更加相关的信息。但是截断毕竟会损失部分信息，如果想要更加全面地展示，数据转换是一...
老师您好，请问，两组数据每组2个样品，对比差异基因，应该用什么方法？我看说的limma包至少每组要3个样品，不知道2个应该怎么对比
...境中，测试主从，高可用等。 多实例配置方案：（多个数据库管理系统） 端口port分开 配置文件分开 socket分开 日志分开 多serverid 都可以使用mysql用户 #总结，初始化多次数据库 创建目录修...
TCGA的临床数据，经过TCGAbiolinks 下载之后，需要保存到文件中，一般大家都希望保存的文件能够采用excel 打开。 但是临床数据中存在几个问题： 1. 一些值缺失，没有值填充 2， 一些字段中存在空格，逗号等 如果直接采用R中...
...it.aes = TRUE) 其中mapping图形属性映射涉及多个，需统计的数据映射到X轴，Y轴映射统计类型（包括频数count 或频率density等），还涉及其他的图像属性等。 统计变换 stat="bin"，对应要设置组距间隔 binwidth大小，由此统计该组间间...
想请教老师一个问题，我用maxquant搜CPTAC一个数据库中的264个文件，结果报错如下maxquantImpl has stopped working.A problem caused the program to stop working correctly, Windows wil close the program and notify you if a solution is available,不知为何，希望老师可以...
自己找了很多序列但是没有一个能像视频课讲解的案例的方式标准化处理，请问老师这些该如何标准化并分析？序列.docx
...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提...
...封装到2维中。二者的差别如下图： （图片源自 ggplot2: 数据分析与图形艺术） 以内置数据mpg 演示 facet_wrap() 使用 ，设置形式 ~ a + b +c 同时可以基于nrow , ncol 修改默认设置 library(ggplot2)> data(mpg)> print(mpg)# A tibble: 23...
用hisat2将数据比对到基因组上，运行时不报错，生成的sam文件为空，生成的summary文件里有报错。请老师指点，谢谢老师。 命令如下： 生成sam文件为空： 生成的summary文件内容： 之前建立索引index文件夹： 换其它输入命令和...
...'GSE112093_raw_exprSet.Rdata') 这是生信大佬的代码 我只改了GSE数据集，但是就提示下载不了，但是原代码上的数据集是可以下载的。错误提示如下：Error in readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) : 无法打开链结 此外: Warning message: In readChar(con, 5L, ...