文章 MeV 绘制热图过程如何对图片颜色做出修改

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 基因家族数据准备运行错误

基因家族数据准备过程中，运行保留蛋白质编码基因命令“agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3” 后运行出现错误，反复几次验证都是错误的，错误代码为gff3...

文章 收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解

...，简单又好用的网站果断收藏！ 转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因...

问题 total RNA测序数据可以用来做miRNA预测分析吗？

我看人家文献中都单独测了sRNA,然后用sRNA测序结果做后续预测分析。但我先只有total rna测序数据，不知道还能比能做miRNA预测分析？

文章 谷歌学术搜索可以用了（免费，不用翻墙）google scholar

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文章 TCGA数据分析ceRNA的套路

...。 1. 研究思路 研究思路详述：     1.1. 从TCGA公开的数据中下载结直肠癌相关的数据，包括lncRNA, miRNA, 编码蛋白的gene的表达数据，和对应病人的临床数据     1.2. 分别就lncRNA, gene, miRNA 比较癌症和癌旁组织中的表达差异   ...

问题 课程里TCGA临床数据下载代码报错

问题 NCBI上传数据中的libraryID是什么？

问题 绘制热图所用数据的样本或处理如何确定

文章 MA plot 绘图计算公式

MA图主要应用在基因组数据可视化方面，实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据，现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下： M一般做Y轴，A一般做X轴。 M常对应差异表达...

文章 进化树中如何添加热图？

...作用，iTOL不会读取该行的内容。 DATASET_HEATMAP：配置文件数据类型声明，这里声明数据集是对进化树添加热图信息。 SEPARATOR SPACE：指定数据分隔符，即数据列与列之间使用空格分隔。 COLOR #ff00ff：指定数据集初始颜色，可在后...

问题 转录组数据分析，差异基因的功能在GO和其他数据库（NR, Swiss_port, Pfam）上有注释，但是KEGG上却没有，这是什么原因造成的，分析的时候应该以哪个为准，求前辈们指点

问题 我的单细胞数据是smart seq3 得到的表达矩阵matrix，如果用您们封存好的seurat R脚本打开，您们那个好像只适用10x的数据，麻烦您解决一下，不然我的课就白买了

问题 老师，我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令；视频中data数据中为gff的后缀，我的数据是gff3的，把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗？

文章 不均等坐标系绘制

    通常来说，进行图片绘制的时候如果存在数据分布差异过大的情况，我们更倾向于选择坐标系截断（gg.map等）的方式去展示于结论更加相关的信息。但是截断毕竟会损失部分信息，如果想要更加全面地展示，数据转换是一...