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文章 win10系统docker 重装提示 Exising installation is up to date 解决方法

...点击右键删除之后,重启,再次安装即可。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 MA plot 绘图计算公式

...课程:GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 WGCNA、生存分析、ROC共同筛选biomarker

...标准化、WGCNA-加权基因共表达网络分析 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据...

文章 cc1plus: error: unrecognized command line option "-Wpedantic"

之前在安装软件时,出现过这种报错信息:cc1plus: error: unrecognized command line option "-Wpedantic" 。 一直不知道是什么问题,网上搜了一下,觉得应该是gcc版本的问题,并且我用的gcc版本确实太低了,更新gcc成最新版本后,再次安...

文章 GSEA分析需要的基因集Molecular Signatures Database是什么?

...基因集(Collection): 点击这些基因集就会展示更详细的信息: H: hallmark gene sets (效应)特征基因集合,共50组;C1: positional gene sets 位置基因集合,根据染色体位置,共326个;C2: curated gene sets:(专家)共识基因集合,基于通...

文章 Infercnv|单细胞转录组拷贝数分析

...。 更多脚本参数设置及说明,通过-h参数获得以下帮助信息: usage: single_cell/infercnv.r [-h] -i rds_data [--assay assay] [--downsample downsample] [--species species] [-t type] -g group [group ...] ...

文章 常见的预后预测的模型介绍

预后预测模型在医学和生物信息学领域中发挥着重要作用,用于预测疾病进展、治疗反应和生存率等重要临床结果。根据数据类型、研究目标和所需的解释性,可以选择不同的统计和机器学习模型。以下是一些常见的预后预测模...

文章 ggplot2不同几何对象所能对应的图形属性

...图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”

...fasterq-dump将srr转换成fastq格式的文件时,出现了如下提示信息: 这提示需要进行配置。可以使用vdb-config –interactive通过互动模式来选择相应的选项,使用vdb-config -h查看各个选项。可以看使用说明(https://github.com/ncbi/sra-tools/wik...

文章 Upset图绘制

...杂时,更加清晰和实用。Upset图的应用广泛,常见于生物信息学、统计学、数据科学等领域。 读入文件 mydata<-read.table("Venn1.txt",header=T,fill=T,check.names=FALSE,row.names = 1,na.strings="")mydata <- mydata[rowSums(mydata) != 0, ]tail(mydata) 文件...

文章 基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用

...白的序列结构图,首先要知道该基因/蛋白的结构及位置信息,查询网站可以选择以下三个数据库:Ensembl:http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Info/IndexNCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Uniprot:https://www.uniprot.org/有了序列结构信息就可以登录IB...

文章 cutree对pheatmap返回结果实现聚类cluster划分

...绘图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 Excel图表保存成高清图片

...图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

问题 老师,您好,找不到临床数据该如何解决?

...######################### > # 注意: 分隔符,需要跟下载临床信息脚本中设置的一致 > datClin = read_delim(clin_file,delim="%",escape_double = FALSE, trim_ws = TRUE) 错误: '/Volumes/HUBGENE/TCGA/methylation/lab/Clinical/GDC/TCGA_OV_clinical.txt' does not exist. > Vie...

文章 简单绘制箱线图

...图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...