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文章 IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

...。在ROC曲线分析中，通过随机选择20%的样本作为测试集，剩余样本为训练集，重复十次后得到了最佳ROC曲线和平均AUC值，用以验证模型的准确性。最后，还使用一组新收集的样本（LH，n=26；HA，n=40）作为测试集，进一步验证了使...

文章 按物种拆分blast本地库

...已知物种的序列信息，在进行blast时，由于数据库较大，搜索时间会比较长，同时可能会有其他物种信息干扰。因此我们可以根据NCBI提供的物种分类号对其进行拆分，下面以nr库进行举例说明。 一、准备 1.1、数据： nr库：https...

文章 MCscan报错——kpsewhich命令缺失

...r_msg)OSError: [Errno 2] No such file or directory: 'kpsewhich' 搜索查询后知道是linux中缺少kpsewhich命令导致的，于是安装该命令，方法如下： sudo yum install tetex-latex tetex-doc tetex-fontssudo yum install texlive tex-live-latex安装好后再次运行，顺...

文章 如何鉴定长距离运输的mRNA?

...嫁接中长距离运输的mRNA是如何鉴定的？今天给大家介绍已经发表的第2种鉴定长距离运输的mRNA的方法，两者方法类似，但也各有不同，该方法引入了SNP用以排除假阳性reads。今天着重介绍下大家都非常关心的实验设计以及分析思...

文章 Windows Terminal 安装与配置指南

...本。 WT 现在已经上架 Microsoft Store，所以直接在商店里搜索安装即可。 2.配置 安装完成之后，WT 默认是长这样的： 修改配置： 可以复制以下内容直接配置文件profiles.json： // To view the default settings, hold "alt" while clicking on th...

文章 Cytoscape如何基于点的属性快速对点和相连的线进行颜色分类

...一个分类属性）: 2、在控制面板中 对应的select中 设定筛选栏，以Node:pathway来(表示Node属性中pathway这一列的数据) 选择其中一个pathway B，即可将属于这一类的点选中（图中黄色点） 选中点之后，进入控制面板style-node 中在第三...

文章 WGCNA知识点详解-提升你的转录组论文档次

...以到我们组学大讲堂的问答社区（www.omicsclass.com.cn）进行搜索。 如果您想学习WGCNA分析的具体操作，可以点以下链接进行学习。 链接：https://study.163.com/course/introduction/1005023004.htm?share=1&shareId=1031484705 更多生物信息课程： ...

文章 浅谈几种常用的蛋白互作实验研究方法!

...的中未知蛋白组分。免疫共沉淀的设计理念是，假设一种已知蛋白是某个大的蛋白复合物的组成成员，那么利用这种蛋白的特异性抗体，就可能将整个蛋白复合物从溶液中“拉”下来，进而可以用于鉴定这个蛋白复合物中的其他...

文章 小公司如何管理好团队？

...极怠工）。 如果有的工作暂时没有想清楚或者没办法分配给唯一负责人可以选择暂时分解到可以估算的程度并为这项工作确定一个团队意识或领导能力较好的主导人员，确保工作可以有序推进。 规定截止时间 在项目推进过...

文章 python特殊属性和方法的详解与运用

...x.color 将 不会 调用x.__getattr__('color')；而只会返回x.color已定义好的值。无论何时给属性赋值，都会调用 __setattr__()方法。无论何时删除一个属性，都将调用 __delattr__()方法。如果定义了 __getattr__() 或 __getattribute__() 方法， _...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465)

...M) 包括单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞和中性粒细胞，已成为癌症生长的关键调节因子。这些细胞可以分化成一系列状态，这些状态可能会促进或限制肿瘤生长，但目前仍知之甚少。在这里，我们使用单细胞 RNA 测序来绘制非...

文章 华西博士3年发46篇SCI论文，论文高产的秘诀你知道吗？

...首先得拿出“证据”来， 学霸姐姐作为一只柠檬精，去搜索了一下邓同学的46篇文章， 发现这46篇文章中， Original research 16篇，其它Comments 9篇，Meta分析10篇，另有letter to the editor若干。 平均下来，每篇大概是2~3分的影响因子...

文章 Win10家庭版也可以装Docker桌面版了！

...的问答社区（www.omicsclass.com）进行提问，也可以直接百度搜索。 常见问题解决方案： 问题1：装上去之后如果有报错Installation failed: Containers Windows Feature is not available可以参考https://www.omicsclass.com/article/1303 问题2：如果卸载不掉...

文章 互联网女皇疫情报告，数字化企业将在今后竞争中获得优势

...体诞生，数字转型的进程正在加快。新的工作与生活平衡已经达成。在许多因此“重塑”的行业中，远程医疗、快速即时诊断、自动化AI等科技与医疗保健的结合，或许正响应了“时代的召唤”。 Mary Meeker指出，全世界GDP前二...

文章 跨物种进化研究必备的‘单拷贝直系同源基因’如何查找

...选择50%的Coverage，视你自己而定evalueExponentCutoff=-5   #blast 筛选的e-value  用过blast的都不默认oracleIndexTblSpc=NONE 具体操作 具体操作步骤包括创建数据库、转换序列格式、过滤、比对、解析结果和聚类等步骤，详细说明如下： （1...