...什么”的问题。 针对“怎么做”的问题，我们根据上千个项目经验，总结了8个最常用的后续个性化挖掘方法，制作了《转录组标准分析后的数据挖掘》，讲述的方法大部分可在Windows下操作，无需linux或者计算机语言的基础。 ...
基因家族分析，既是一个可以快速掌握的生物信息分析技能，也是低成本SCI文章思路。基因家族文章写作模式相似，换个物种或者基因家族就又是一篇文章，可借鉴性很强，且发文数量依然不减，是低成本短、平、快SCI文章的...
接上个问题：老师为啥基因组gff文件没有内含子序列呢？另外gene为啥和mRNA一样长啊，不应该gene更长吗？
qRT-PCR是一种相对表达定量的方法，他的计算方法有很多，常用的相对定量数据分析方法是KJ Livak（Applied Biosystems）等人在2001年提出的“比较Ct法相对定量”，即：利用ΔCt值差异来推算基因表达差异（Ct目的基因 – Ct内参基因 = Δ...
我想做圈图，由于在一个位置上有12个基因，直接用标签没办法显示，想问问老师，这个图中的红色标注的折线是怎么实现的呢？
...章。当然，小编做的统计也不完全，但无论完全与否，两个月的时间150多篇文章，这个数量已经非常可观了。这也强有力的说明了“基因家族分析类文章依然坚挺好发”。 小编也特意挑选了一篇本月刚发表在Genomics（IF：3.16）...
...害后0, 2, 4, 12和 24 h后玉米叶片进行转录组测序分析，对5个时间点样本转录组基因表达水平PCA分析发现0h和2-, 4-, 12- 和 24-h样本明显分离（图a），表明玉米螟为害对玉米叶片基因表达产生了显著影响。 为害后2-h, 4-h,12-h and 24-h...
RagTag是一个集合功能的软件可以用来构建scaffold、提升基因组组装质量，其主要功能用法如下： usage: ragtag.py <command> [options] assembly improvement: correct homology-based misassembly correction scaffold h...
..._vs_tumor.DEG.final.tsv 文件与demo中的基因数量不同，demo中319个基因，而自己练习生成的数据是92个，为了排除bug原因，尝试使用demo中normal_vs_tumor.DEG.final.tsv 进行KEGG富集，发现依然如上报错。使用chatgpt查询代码错误，提示检查输入...
在Linux系统中，grep（Global Regular Expression Print）是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行，并将其打印出来。今天，我们结合以下示例，深入了解一下grep命令的详细使...
...冻，-80度保存，并提取RNA，用于转录组测序分析。一共4个样品：W+HRW、W、UV-A、UV-A + HRW，两两对比形成差异组合。共鉴定出14564个差异基因。并通过聚类热图、维恩图等来进一步分析了各个差异组合中差异基因的上下调情况。 3...
老师您好， 按照视频讲解在使用MCscanX 进行基因组内共线性分析时，出来了串联重复的文件，可怎么判断片段复制？（视频中讲解在提取过程中，最后出来个片段复制，这是依据什么出来的？）