找到约 15 条结果

问题 juicer 报错： Failure during chimera handling of

...me/data/t090519/JF/20.Jui/juicer/work/splits/JF2.fastq.gz附件为nohup.out信息，报错在最后几行nohup.out

文章 R语言-文件行名重复，对行名重命名

...现了行名重复的情况，会导致报错： 文件内容： 报错信息： 此时需要对重复的行名进行重命名处理，方法一： 先不读取行名，使用make.names函数给行命名： d<-read.table("test.xls", header = T, check.names = F) row.names(d)<-make.names(...

文章 win10 安装最新的基于WSL2的docker

...+ 或 18363.1049+，次要内部版本号需要高于 .1049。 阅读详细信息：WSL 2 即将支持 Windows 10 版本 1903 和 1909。 请参阅疑难解答说明。 步骤 3 - 启用虚拟机功能 安装 WSL 2 之前，必须启用“虚拟机平台”可选功能。 计算机需要虚拟化...

文章 linux 重定向

...xt Hello 可以看到正确的输出保存到result.txt文件，而错误信息输出到了屏幕。 执行下面的操作： python test.py 1> right.txt 2>wrong.txt $cat right.txtHello$cat wrong.txtTraceback (most recent call last):  File "test.py", line 4, in <module>    int('He...

文章 遗传图构建-SNP标记分型

...型 对于高通量测序的SNP数据我们该如何根据父母本的SNP信息对子代进行分型呢；这里我们看一下下图，其中P1为杂合亲本，另一个亲本P2为纯合亲本；由于P2为纯合亲本交换我们观察不到（下图a），我们把亲本P2的基因型编码为a...

问题 老师你好，在家族分析中，用tiquxulie.pl脚本提取序列时，总是报错，看了前面他们做的，我拆成每条染色体进行提取，但还是不行

这是我提取的基因信息 这是tiquxulie.pl脚本 运行的脚本

问题 启动子分析，使用get_promoter.pl提取上游序列时发生如下报错（不能读取脚本第31行），请问该怎么修正啊？

...好像有问题下图是我使用的get_promoter.pl这个脚本的第31行信息，这个脚本我从网盘下载后没有作任何修改 请问老师错误是出在哪里了，怎么修正啊？ 谢谢老师！

文章 转录组扫盲篇

...因家族分析类文章的期刊，供您投稿时参考！ 此Excel包含信息如下：期刊名称、期刊名缩写、影响因子、中科... 总有同学咨询基因家族分析类文章可以投哪些期刊，闲暇之余，小编就整理了一下接收过基因家族分析类文章的期...

文章 qiime2 分类器建立 SILVA数据库

...-ssu-nr99-tax.qza 这个代码自动获取 99相似性的序列和分类信息，由于网络原因一般运行报错 可以直接下载qiime2官方网站i提供的文件：https://docs.qiime2.org/2020.8/data-resources/ wget -c https://data.qiime2.org/2020.8/common/silva-138-99-seqs.qzawget -c ...

文章 加权基因共表达网络（WGCNA）寻找与疾病相关的hub基因

... Genome Biology. 2017;18:70. doi:10.1186/s13059-017-1194-2. 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

问题 在virtualbox中导入虚拟电脑的bio-linux的ova失败~老师

报错信息： 导入虚拟电脑 E:\Bio-Linux-2018-8-23.ova失败. Could not create the imported medium 'F:\bio-linux\Bio-Linux-2018-8-23-disk001.vmdk'. VMDK: cannot write allocated data block in 'F:\bio-linux\Bio-Linux-2018-8-23-disk001.vmdk' (VERR_DISK_FULL). 返回 代码:VBOX_E_FILE_ERROR ...

文章 Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具

...常，这个文件包含了各个群体中不同位点的等位基因频率信息。文件格式一般为文本格式，每一行代表一个位点，每一列对应一个群体。例如： 数字分别表示不同群体在这些位点上的基因型数目。此外，还需要提供一个群体...

文章 dQTL.seq方法研究基因定位

...。 2. 数据文件准备 01. 通过数据分析获得混池的snp位点信息all_sample_snp.vcf。 对all_sample_snp.vcf中的snp位点进行过滤，过滤掉亲本杂合以及亲本相同的位点。 02. 格式转换 /share/work/biosoft/GATK/latest/gatk VariantsToTable -V all_sample_snp.vc...

问题 请问老师做无参转录组分析某一家族基因可以把其核苷酸序列翻译为蛋白序列后比对吗？

...不是很全面，但是我大致浏览了一下，还是有一定的有用信息，所以考虑做这方面的分析。老师评价一下？谢谢！

问题 老师，使用非ensemble数据库的蛋白质序列和基因组染色体fasta文件脚本要怎么进行修改呢？

...我是应该如何修改脚本，或者整理来自其他数据库的序列信息呢？