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问题 在装作者提供的11g的biolinux系统的时候不能全屏显示,不能挂载,显示no such device

补问:在用官网的biolinux系统做motife分析的时候,输入meme软件的时候,显示没有这个软件,请问怎么安装? 初涉生物信息,不胜感激

问题 细胞测序使用subset脚本提出子集,再进行拟时分析报错plot_genes_by_group

Error in plot genes by group(cds, top specific marker ids, group cells by = "partition", Only one type in group_cells by. To use plot genes by group, please specify a group with more than one type

问题 NCBI fasta格式文件的模板

老师,我想创建一个fasta格式的文件,我看到别人说NCBI上有模板,请问模板在哪里找呀

文章 DNBelab C4单细胞RNA-Seq文库制备

DNBelab C4单细胞RNA-Seq文库制备DNBelab C4单细胞RNA-Seq文库制备流程基于Drop-Seq技术原理,匹配自主研发的多磁珠识别技术,包括两种捕获磁珠,分别为大磁珠和小磁珠。大磁珠表面修饰有长、短两种捕获序列,数目多达10的7次方。长...

文章 计算肿瘤纯度和免疫评分 R包总结

...与免疫评分,预测肿瘤纯度; ABSOLUTE :是能够定量肿瘤细胞纯度、倍性、绝对拷贝数的包; ESTIMATE就是一种预测肿瘤纯度的工具,使用表达数据估计恶性肿瘤组织中的基质细胞和免疫细胞并且可以利用基因表达数据预测肿瘤...

问题 三代HIFI数据的格式

我在公司做的三代测序,PACBIO HIFI ,计划做基因组组装。公司提供的是原始的BAM文件和bam.pbi文件,我需要将BAM文件转换成fastq文件才可以组装。请问要怎样才可以转换格式

问题 Virtural_Box工具导入Bio_Linux文件(ova)报错,问题如下

老师,我导入Bio_Linux时报出这种错误,该怎么解决呢?电脑BIos中的虚拟设置已经打开了,win10系统

问题 老师您好,我线下上过您的基因家族培训课程,目前在尝试用大豆基因组进行分析,但我发现从ENSEMBLEPLANT下载的基因组序列格式跟拟南芥的注释格式不一样,我已经尝试着进行了 一些编辑,但还是无法统一ID,麻烦您帮我解决一下这种基因组注释格式修改问题

...Glycine_max_v2.1.cds.all.fa , Glycine_max.Glycine_max_v2.1.pep.all.fa ,格式信息如截图所示(我在基因家族培训QQ群里发布的那张图是我自己尝试编辑修改后的),期待您的帮助,非常感谢!

文章 python运行单细胞umap报错

> library(umap) > library(reticulate) > iris.data = iris[, grep("Sepal|Petal", colnames(iris))] > iris.umap_learn = umap(iris.data, method="umap-learn") Error: Python shared library not found, Python bindings not loaded. 解决办法:重新编译python  :  ./configure --e...

文章 TWAS分析的原理和工具

...数据的一个概括总结,包含了结果中最核心的信息,这类格式的GWAS数据通常来源于已经公开发表的文章和各类数据库中。

文章 蛋白质亚细胞定位method

Prediction of secondary structure and subcellular localization of apple BES1 proteins The secondary structure of apple BES1 Proteins was analyzed with NPS@: SOPMA secondary structure prediction (https://www.predictprotein.org/signin). The subcellular localization prediction of apple BES1 proteins wa...

问题 目的:安装Docker Desktop 1.本人电脑:win10家庭版 2.做了什么:开启CPU虚拟化、开启Hyper-V、获得下载地址、在注册表编辑器中改了Professional、桌面上新建containers.cmd并以管理员身份运行 3.产生结果:c盘内存从7G变成2G,Docker结果显示,磁盘空间不足,……引发异常的上一位置中堆栈跟踪的末尾……,再次点击变成如图一所示, 4.请老师指教呀

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话题 GenePred格式