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问题 如何采用TCGA数据进行生存分析

问题 TCGA有那些公开数据可以下载?

问题 三代全长转录组推荐测多少数据

问题 请问,能进行数据处理分析吗?

问题 如何下载别人的重测序数据

问题 GEO数据挖掘中遇见的问题

老师你好, 在学习GEO数据挖掘的课程中,在GO富集分析过程中,课程用的是人的基因注释R包:org.Hs.eg.db,请问做水稻用什么基因注释R包呢?我用拟南芥的R包org.At.tair.db总是出问题。谢谢!

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌(GSE123813)

...们单细胞课程的学员利用我们提供的脚本快速的分析公共数据数据挖掘,这里开始记录一下不同公共数据相关分析shell代码。大家有了我们的代码就可以照抄分析,提高分析数据效率,今天是第1个数据,后续还有数据慢慢给大...

文章 affy包查看全匹配探针与错配探针

...敏度大大提高,也便于进行背景校正等。而由于芯片原始数据处理的方法不同,有时会利用错配探针信号,而有时并不会参考错配探针信息。譬如,常见的 RMA算法进行数据标准化并未利用到mm信号值,mas5 方法则要参考mm进行计...

问题 如何从TCGA下载长链非编码RNA的数据

一些文章中说长链非编码RNA的数据是从TCGA下载的,请问如何下载?

问题 基因组注释数据库解压失败

1. 我下载了基因组注释的7个数据库(database.tar.gz.0到database.tar.gz.6),上传到服务器,cat database.tar.gz.* > database.tar.gz后,解压缩失败 2. 我换了一个电脑下载,换了一个硬盘上传,结果也是一样

文章 R 语言colors()657种颜色

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌(HCC)(GSE149614)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肝细胞癌(HCC)代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里,我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组:原发肿瘤、门静脉肿瘤血栓 (PVTT)、转移淋巴结...

问题 GEO数据差异基因的分析

这个命令执行不了,错误提示是什么意思,需要怎么改

话题 微生物多样性数据实操

问题 TCGA下载数据报错“I could not find the file”

我按照教程执行命令,想借此下载自己感兴趣的数据 在执行到GDC下载这一步,突然出现下载数据找不到,而出现下载中断,无法继 还有个问题,查询到的样品数目为何和癌症和癌旁样本加起来不一样。。。。少的去哪里了