3 pacbio转录组数据处理

在进行isoseq流程时,在做lima这一步时,需要输入

barcoded_primers.fasta 文件,文件格式序列名字需要加上5p或3p,自己的数据有一个barcode.fasta文件,但是序列名没有标5p或3p,barcode和primer是有什么关系,lima输入的barcoded_primers.fasta文件应该是什么样?不是公司给的barcode.fasta文件么?
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1 个回答

Daitoue
擅长:生命科学,生物信息

不是barcode.fasta文件 直接找测序公司要一下5p 和3p序列

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  • 田萧 提出于 2019-10-07 19:36